RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022507.12

Pspc1-201, Transcript of Paraspeckle component 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pspc1, Length 4,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Fbxw19Q8C2W8 466 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 RtknQ8C6B2 564 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Zfpm2Q8CCH7 1151 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 TbccQ8VCN9 341 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Eif4a3Q91VC3 411 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Nrif1Q923B3 828 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 NonoQ99K48 473 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gipc2Q9Z2H7 314 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Adgrf5G5E8Q8 1348 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 SlxD3Z347 212 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Zbtb10E9Q8X5 861 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Teddm2Q208S0 260 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Pydc3Q3V3Q4 588 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ubn1Q4G0F8 1135 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Myo19Q5SV80 963 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Brip1Q5SXJ3 1174 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 SyncripQ7TMK9 623 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Olfr813Q7TRH5 310 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Bpifb3Q80ZU7 473 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 IrgqQ8VIM9 583 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Tsc22d4Q9EQN3 387 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Snap29Q9ERB0 260 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rgs1Q9JL25 209 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Pnpla6Q3TRM4 1355 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Plch1Q4KWH5 1682 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gm3173A6NAS3 172 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gm14525B1AZA0 212 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ccdc78D3Z5T1 437 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gm2030D3Z7C4 212 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gm3020E9Q3J7 150 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gm2897K7N6T7 172 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 PparaP23204 468 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Sec23aQ01405 765 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Clhc1Q5M6W3 596 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Atp11bQ6DFW5 1175 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 RragaQ80X95 313 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 4933430I17RikQ8BHW4 495 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 3830417A13RikQ8BQJ2 303 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ttc26Q8BS45 554 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Atg16l1Q8C0J2 607 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gm3411Q8C7R2 150 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Nrbf2Q8VCQ3 287 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rbm47Q91WT8 590 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Fastkd2Q922E6 689 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Bco2Q99NF1 532 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Col1a1P11087 1453 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rrn3B2RS91 656 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ppef1O35655 650 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rad51bO35719 350 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 S100a1P56565 94 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Sez6lQ6P1D5 963 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Siglec10Q80ZE3 688 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Pi4k2bQ8CBQ5 469 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Alg3Q8K2A8 438 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Slc5a9Q8VDT1 685 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Slc5a2Q923I7 670 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Phc2Q9QWH1 850 aa11.84□□□□□ -0.51
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Col5a2Q3U962 1497 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Arhgef37A1IGU4 676 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Cdh5P55284 784 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Nr4a2Q06219 598 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Sec31aQ3UPL0 1230 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Cnga4Q3UW12 575 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 HnrnpdQ60668 355 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gja6Q6S5G4 283 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Fam185aQ7TPD2 378 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Teddm1aQ810U2 305 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Slc6a15Q8BG16 729 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Stard7Q8R1R3 373 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Trpv6Q91WD2 767 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Nek3Q9R0A5 511 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ifnb1P01575 182 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Sar1aP36536 198 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Stat3P42227 770 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Fam47cQ14BE7 430 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Tmprss11eQ5S248 423 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Adgre1Q61549 931 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Senp5Q6NXL6 749 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Scube1Q6NZL8 1018 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Slc39a10Q6P5F6 833 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Fbxo10Q7TQF2 950 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Btnl1Q7TST0 509 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ccdc68Q8BVC4 333 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Nrbp2Q91V36 499 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Cd209dQ91ZW8 237 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Rnf181Q9CY62 165 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Gstt4Q9D4P7 240 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ccdc120A2AEV7 629 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 4930579F01RikE9Q3L6 325 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 TxnP10639 105 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 PorP37040 678 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Fosl2P47930 326 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Sult2a2P50236 285 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Snx27Q3UHD6 539 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Ankrd53Q3V0J4 497 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 WhrnQ80VW5 918 aa11.83□□□□□ -0.52
Pspc1-201ENSMUST00000022507 Saysd1Q8K190 188 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.8 ms