Protein–RNA interactions for Protein: Q06219

Nr4a2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a2Q06219 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Nr4a2Q06219 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nr4a2Q06219 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nr4a2Q06219 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nr4a2Q06219 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Nr4a2Q06219 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Nr4a2Q06219 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Nr4a2Q06219 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Nr4a2Q06219 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nr4a2Q06219 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nr4a2Q06219 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nr4a2Q06219 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nr4a2Q06219 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nr4a2Q06219 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nr4a2Q06219 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Nr4a2Q06219 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nr4a2Q06219 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Nr4a2Q06219 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Nr4a2Q06219 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nr4a2Q06219 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nr4a2Q06219 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nr4a2Q06219 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nr4a2Q06219 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nr4a2Q06219 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nr4a2Q06219 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nr4a2Q06219 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nr4a2Q06219 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nr4a2Q06219 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nr4a2Q06219 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nr4a2Q06219 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Nr4a2Q06219 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nr4a2Q06219 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nr4a2Q06219 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Nr4a2Q06219 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nr4a2Q06219 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nr4a2Q06219 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nr4a2Q06219 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nr4a2Q06219 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nr4a2Q06219 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nr4a2Q06219 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nr4a2Q06219 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nr4a2Q06219 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nr4a2Q06219 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nr4a2Q06219 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nr4a2Q06219 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nr4a2Q06219 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Nr4a2Q06219 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nr4a2Q06219 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nr4a2Q06219 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nr4a2Q06219 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nr4a2Q06219 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nr4a2Q06219 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nr4a2Q06219 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nr4a2Q06219 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nr4a2Q06219 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nr4a2Q06219 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Nr4a2Q06219 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nr4a2Q06219 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nr4a2Q06219 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Nr4a2Q06219 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nr4a2Q06219 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nr4a2Q06219 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nr4a2Q06219 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nr4a2Q06219 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Nr4a2Q06219 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nr4a2Q06219 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nr4a2Q06219 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Nr4a2Q06219 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nr4a2Q06219 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr4a2Q06219 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nr4a2Q06219 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nr4a2Q06219 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr4a2Q06219 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nr4a2Q06219 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr4a2Q06219 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nr4a2Q06219 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr4a2Q06219 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr4a2Q06219 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr4a2Q06219 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nr4a2Q06219 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr4a2Q06219 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr4a2Q06219 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nr4a2Q06219 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr4a2Q06219 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr4a2Q06219 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr4a2Q06219 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr4a2Q06219 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nr4a2Q06219 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nr4a2Q06219 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nr4a2Q06219 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nr4a2Q06219 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nr4a2Q06219 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nr4a2Q06219 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nr4a2Q06219 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nr4a2Q06219 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nr4a2Q06219 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nr4a2Q06219 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nr4a2Q06219 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nr4a2Q06219 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nr4a2Q06219 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms