RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		-4.56	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		-4.56	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	-4.56	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		-4.56	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	-4.56	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	-4.56	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		-4.56	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		-4.56	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	-4.56	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	-4.56	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		-4.56	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		-4.56	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		-4.56	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	-4.56	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		-4.56	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		-4.56	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	SPC2	Q04969	178 aa		-4.58	□□□□□ -3.14
VAR1	Q0140	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	-4.6	□□□□□ -3.15
VAR1	Q0140	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	-4.62	□□□□□ -3.15
VAR1	Q0140	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		-4.63	□□□□□ -3.15
VAR1	Q0140	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		-4.63	□□□□□ -3.15
VAR1	Q0140	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		-4.63	□□□□□ -3.15
VAR1	Q0140	SPC1	P46965	94 aa		-4.63	□□□□□ -3.15
VAR1	Q0140	YOS1	Q3E834	85 aa		-4.63	□□□□□ -3.15
VAR1	Q0140	NHP10	Q03435	203 aa		-4.66	□□□□□ -3.16
VAR1	Q0140	LYS2	P07702	1392 aa		-4.67	□□□□□ -3.16
VAR1	Q0140	YBR090C	P38253	122 aa		-4.68	□□□□□ -3.16
VAR1	Q0140	ATP18	P81450	59 aa		-4.69	□□□□□ -3.16
VAR1	Q0140	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		-4.7	□□□□□ -3.16
VAR1	Q0140	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		-4.71	□□□□□ -3.16
VAR1	Q0140	STT4	P37297	1900 aa		-4.74	□□□□□ -3.17
VAR1	Q0140	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		-4.77	□□□□□ -3.17
VAR1	Q0140	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		-4.77	□□□□□ -3.17
VAR1	Q0140	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		-4.77	□□□□□ -3.17
VAR1	Q0140	TY2B-C	P25384	1770 aa		-4.77	□□□□□ -3.17
VAR1	Q0140	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		-4.77	□□□□□ -3.17
VAR1	Q0140	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	-4.77	□□□□□ -3.17
VAR1	Q0140	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		-4.77	□□□□□ -3.17
VAR1	Q0140	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		-4.77	□□□□□ -3.17
VAR1	Q0140	TY2B-B	Q12491	1770 aa		-4.77	□□□□□ -3.17
VAR1	Q0140	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		-4.77	□□□□□ -3.17
VAR1	Q0140	DYN1	P36022	4092 aa		-4.78	□□□□□ -3.17
VAR1	Q0140	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	-4.79	□□□□□ -3.18
VAR1	Q0140	YBR032W	P38223	100 aa		-4.8	□□□□□ -3.18
VAR1	Q0140	YCR085W	P25650	117 aa		-4.81	□□□□□ -3.18
VAR1	Q0140	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		-4.81	□□□□□ -3.18
VAR1	Q0140	YAL065C	O13511	128 aa		-4.82	□□□□□ -3.18
VAR1	Q0140	YHR050W-A	Q05451	56 aa		-4.83	□□□□□ -3.18
VAR1	Q0140	UBC5	P15732	148 aa		-4.84	□□□□□ -3.18
VAR1	Q0140	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		-4.84	□□□□□ -3.18
VAR1	Q0140	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	-4.84	□□□□□ -3.18
VAR1	Q0140	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	-4.85	□□□□□ -3.19
VAR1	Q0140	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		-4.85	□□□□□ -3.19
VAR1	Q0140	UBC4	P15731	148 aa		-4.86	□□□□□ -3.19
VAR1	Q0140	BSC4	P53841	131 aa		-4.87	□□□□□ -3.19
VAR1	Q0140	YHL005C	P38752	130 aa		-4.88	□□□□□ -3.19
VAR1	Q0140	EMC5	P40540	141 aa		-4.9	□□□□□ -3.19
VAR1	Q0140	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	-4.99	□□□□□ -3.21
VAR1	Q0140	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	-4.99	□□□□□ -3.21
VAR1	Q0140	YER039C-A	P0CD97	72 aa		-5	□□□□□ -3.21
VAR1	Q0140	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	-5	□□□□□ -3.21
VAR1	Q0140	YMR103C	Q04436	120 aa		-5	□□□□□ -3.21
VAR1	Q0140	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		-5.01	□□□□□ -3.21
VAR1	Q0140	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		-5.01	□□□□□ -3.21
VAR1	Q0140	HMRA1	P0CY11	126 aa		-5.04	□□□□□ -3.22
VAR1	Q0140	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	-5.04	□□□□□ -3.22
VAR1	Q0140	ECM29	P38737	1868 aa		-5.05	□□□□□ -3.22
VAR1	Q0140	SPP41	P38904	1435 aa		-5.06	□□□□□ -3.22
VAR1	Q0140	MOT1	P32333	1867 aa		-5.09	□□□□□ -3.22
VAR1	Q0140	QCR6	P00127	147 aa		-5.09	□□□□□ -3.22
VAR1	Q0140	SPO14	P36126	1683 aa		-5.11	□□□□□ -3.23
VAR1	Q0140	FPR2	P32472	135 aa		-5.12	□□□□□ -3.23
VAR1	Q0140	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		-5.12	□□□□□ -3.23
VAR1	Q0140	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	-5.14	□□□□□ -3.23
VAR1	Q0140	WIP1	Q2V2P8	89 aa		-5.14	□□□□□ -3.23
VAR1	Q0140	VTH1	P40438	1549 aa		-5.14	□□□□□ -3.23
VAR1	Q0140	VTH2	P40890	1549 aa		-5.14	□□□□□ -3.23
VAR1	Q0140	MEC1	P38111	2368 aa		-5.18	□□□□□ -3.24
VAR1	Q0140	PAU23	Q07987	124 aa		-5.23	□□□□□ -3.25
VAR1	Q0140	PAU17	Q12370	124 aa		-5.23	□□□□□ -3.25
VAR1	Q0140	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	-5.24	□□□□□ -3.25
VAR1	Q0140	YDR029W	Q12111	104 aa		-5.24	□□□□□ -3.25
VAR1	Q0140	RRT15	Q3E811	62 aa		-5.24	□□□□□ -3.25
VAR1	Q0140	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		-5.25	□□□□□ -3.25
VAR1	Q0140	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		-5.27	□□□□□ -3.25
VAR1	Q0140	TOS6	P48560	102 aa		-5.28	□□□□□ -3.25
VAR1	Q0140	SIP18	P50263	79 aa		-5.29	□□□□□ -3.26
VAR1	Q0140	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	-5.31	□□□□□ -3.26
VAR1	Q0140	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	-5.35	□□□□□ -3.27
VAR1	Q0140	FYV7	Q12247	151 aa		-5.36	□□□□□ -3.27
VAR1	Q0140	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	-5.39	□□□□□ -3.27
VAR1	Q0140	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	-5.4	□□□□□ -3.27
VAR1	Q0140	POL1	P13382	1468 aa		-5.4	□□□□□ -3.27
VAR1	Q0140	YOR304C-A	O14468	76 aa		-5.41	□□□□□ -3.28
VAR1	Q0140	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	-5.42	□□□□□ -3.28
VAR1	Q0140	MHF2	Q3E829	80 aa		-5.42	□□□□□ -3.28
VAR1	Q0140	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	-5.45	□□□□□ -3.28
VAR1	Q0140	PDR11	P40550	1411 aa		-5.46	□□□□□ -3.28
VAR1	Q0140	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	-5.5	□□□□□ -3.29
VAR1	Q0140	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	-5.51	□□□□□ -3.29

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