RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	EURL	Q9NYK6	297 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	KBTBD13	C9JR72	458 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TOM1L1	O75674	476 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	GRAP2	O75791	330 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PEX6	Q13608	980 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CUL2	Q13617	745 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	AGR3	Q8TD06	166 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	COPE	O14579	308 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	KIF3C	O14782	793 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CIB2	O75838	187 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	KRT34	O76011	436 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PDE5A	O76074	875 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ZWINT	O95229	277 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ACADS	P16219	412 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RANBP1	P43487	201 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CPT1B	Q92523	772 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TRIM11	Q96F44	468 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	C19orf81	C9J6K1	198 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482		H7C0C1	242 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482		I3L4J1	428 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ARIH2	O95376	493 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ATP5O	P48047	213 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RAB27A	P51159	221 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CHI3L2	Q15782	390 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RSPH3	Q86UC2	560 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SENP1	Q9P0U3	644 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ALOX15B	O15296	676 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	UGT1A9	O60656	530 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	STAM2	O75886	525 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RBP3	P10745	1247 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	MUT	P22033	750 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	AQP5	P55064	265 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	BPIFB4	P59827	614 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	MYBPC2	Q14324	1141 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	MORF4L2	Q15014	288 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	MROH9	Q5TGP6	573 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	TREML1	Q86YW5	311 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	KCTD6	Q8NC69	237 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	APOL6	Q9BWW8	343 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ETAA1	Q9NY74	926 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	ZMPSTE24	O75844	475 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	EDN1	P05305	212 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC25A3	Q00325	362 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CDK16	Q00536	496 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	KRT76	Q01546	638 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	GCNT1	Q02742	428 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	C4orf19	Q8IY42	314 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	CDCA5	Q96FF9	252 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		10.48	□□□□□ -0.73
SPIN3-222	ENST00000639482	MMP19	Q99542	508 aa		10.48	□□□□□ -0.73

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