RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 SHC4Q6S5L8 630 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF516Q92618 1163 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 ELOVL4Q9GZR5 314 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 DPEP3Q9H4B8 488 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 CPQQ9Y646 472 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 UBE4BO95155 1302 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 ANTXRLA6NF34 631 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 CUTAO60888 179 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 STAU1O95793 577 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 CAVIN2O95810 425 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 ABL1P00519 1130 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 SEC13P55735 322 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 CREB5Q02930 508 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 RASSF3Q86WH2 238 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 NELFCDQ8IXH7 590 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 XYLT2Q9H1B5 865 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 SMPD4Q9NXE4 827 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 MMP17Q9ULZ9 603 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 USP24Q9UPU5 2620 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 ABCA7Q8IZY2 2146 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 ZFHX4Q86UP3 3567 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 YEATS4O95619 227 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 PMLP29590 882 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 GBP1P32455 592 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 DHCR24Q15392 516 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 ST3GAL2Q16842 350 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 RNF43Q68DV7 783 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 UNC13DQ70J99 1090 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 C11orf74Q86VG3 221 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 SLITRK1Q96PX8 696 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 B3GNT5Q9BYG0 378 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 INVSQ9Y283 1065 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 CEP295Q9C0D2 2601 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN5O00501 218 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 ATICP31939 592 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 MYL6P60660 151 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 TRPC3Q13507 836 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 ANO7Q6IWH7 933 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 CHAMP1Q96JM3 812 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 TPSD1Q9BZJ3 242 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEF1Q9HAY2 307 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 CFAP97Q9P2B7 532 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRF-216ENST00000617451 A8MXQ7 604 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 SLC6A11P48066 632 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 CRY1Q16526 586 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 BMT2Q1RMZ1 405 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 PMS2CLQ68D20 193 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 RHBDF2Q6PJF5 856 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 C12orf56Q8IXR9 622 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 NUP93Q8N1F7 819 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC33Q8N5R6 958 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 EDEM2Q9BV94 578 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 KCNK5O95279 499 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 YWHAQP27348 245 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 CASP1P29466 404 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 MESP2Q0VG99 397 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 SFTPA1Q8IWL2 248 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 MDGA1Q8NFP4 955 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 PNKPQ96T60 521 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 BLZF1Q9H2G9 400 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 VRTNQ9H8Y1 702 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0A0MRY4 1105 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 SHC2P98077 582 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM92Q6UXU6 159 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 PDZD8Q8NEN9 1154 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 OVCA2Q8WZ82 227 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 SLC39A2Q9NP94 309 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 LNP1A1A4G5 178 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 KAT7O95251 611 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 ADH1CP00326 375 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 BCKDHBP21953 392 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 C12orf40Q86WS4 652 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRF-216ENST00000617451 ALLCQ8N6M5 410 aa26.48■■□□□ 1.83
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