RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586539.5

ABCA8-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 8, human

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCA8, Length 5,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA8-208	ENST00000586539	CYP11B2	P19099	503 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	SLC9A1	P19634	815 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ATP6V1C1	P21283	382 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	PPP4C	P60510	307 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	RAET1E	Q8TD07	263 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ELP3	Q9H9T3	547 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	PRKCB	P05771	671 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	RALA	P11233	206 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	SOX5	P35711	763 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	C5orf22	Q49AR2	442 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	CCRL2	O00421	344 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	CCNK	O75909	580 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ITGAL	P20701	1170 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	NR1H2	P55055	460 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	CYP27A1	Q02318	531 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	TRIQK	Q629K1	86 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	CPVL	Q9H3G5	476 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	KPNA7	A9QM74	516 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	FYN	P06241	537 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ATP1A3	P13637	1013 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	LPIN1	Q14693	890 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ARSH	Q5FYA8	562 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	KCNK18	Q7Z418	384 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	MTMR9	Q96QG7	549 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	USP1	O94782	785 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	IL32	P24001	234 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ERF	P50548	548 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	MMRN1	Q13201	1228 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	DCLK2	Q8N568	766 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	USP27X	A6NNY8	438 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ACADVL	P49748	655 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	RAD51	Q06609	339 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	SREBF2	Q12772	1141 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	TRAF2	Q12933	501 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ZNF846	Q147U1	533 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	CDO1	Q16878	200 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	MCU	Q8NE86	351 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	FAM187A	A6NFU0	413 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	KBTBD13	C9JR72	458 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ZNF862	O60290	1169 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	IL18RAP	O95256	599 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	CCR3	P51677	355 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	P3H2	Q8IVL5	708 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	POC5	Q8NA72	575 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	POLI	Q9UNA4	740 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	PALM	O75781	387 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	BLMH	Q13867	455 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	KIF12	Q96FN5	646 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	IFT43	Q96FT9	208 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ABCA8-208	ENST00000586539	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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