RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 HEATR9A2RTY3 570 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 OR1G1P47890 313 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 DGKDQ16760 1214 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 IYDQ6PHW0 289 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 BBS2Q9BXC9 721 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 SESN1Q9Y6P5 492 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 PTPRUQ92729 1446 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 E9PCH4 1651 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 H3BQF6 201 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 ICAM1P05362 532 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC142Q17RM4 750 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 BBS7Q8IWZ6 715 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 RASSF9O75901 435 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 SUPT7LO94864 414 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 WASHC5Q12768 1159 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 HEATR4Q86WZ0 1026 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRM-211ENST00000580170 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 O00370 1275 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 VWA5AO00534 786 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 PDK2Q15119 407 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 VPS37AQ8NEZ2 397 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 DDIT4Q9NX09 232 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 WWOXQ9NZC7 414 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 RNF112Q9ULX5 631 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 NUP107P57740 925 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 TMC5Q6UXY8 1006 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 GYS1P13807 737 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 UGT3A1Q6NUS8 523 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 KLK14Q9P0G3 267 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 UPP2O95045 317 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 RAET1EQ8TD07 263 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 F8VZ95 297 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 AQP5P55064 265 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM121Q9BTD3 319 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CRLS1Q9UJA2 301 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP99D6REC4 459 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 FAR2Q96K12 515 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 IMPDH2P12268 514 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 RAP1GAPP47736 663 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CCNJLQ8IV13 435 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CAVIN3Q969G5 261 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 YIPF2Q9BWQ6 316 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 PPP4CP60510 307 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 BTN2A2Q8WVV5 523 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 OMA1Q96E52 524 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 EFCAB1Q9HAE3 211 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 VDRP11473 427 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 CALB2P22676 271 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 TAGLN3Q9UI15 199 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 OGTO15294 1046 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 PAX7P23759 505 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 DMPKQ09013 629 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 AP5Z1O43299 807 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 GLRBP48167 497 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRM-211ENST00000580170 ACOT1Q86TX2 421 aa22.05■■□□□ 1.12
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