RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACBD3Q9H3P7 528 aa30.54■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa30.54■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRD1A4D1F6 860 aa30.53■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 PI4K2BG5E9Z4 385 aa30.53■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa30.53■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-208ENST00000573600 IL1R2P27930 398 aa30.53■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC14Q49A88 953 aa30.53■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa30.53■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNAH12Q6ZR08 3092 aa30.53■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 GRK7Q8WTQ7 553 aa30.53■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAPGEF5Q92565 580 aa30.53■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-208ENST00000573600 DUPD1Q68J44 220 aa30.53■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-208ENST00000573600 THEM5Q8N1Q8 247 aa30.53■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM51Q9BSJ1 452 aa30.53■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa30.53■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRT82Q9NSB4 513 aa30.53■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBC1D13Q9NVG8 400 aa30.53■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa30.52■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PTPN9P43378 593 aa30.52■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP30.52■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAF5Q15542 800 aa30.52■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 COLGALT2Q8IYK4 626 aa30.52■■■□□ 2.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCDHB8Q9UN66 801 aa30.52■■■□□ 2.48
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CTDNEP1-208ENST00000573600 DAPK3O43293 454 aa30.51■■■□□ 2.47
CTDNEP1-208ENST00000573600 ECEL1O95672 775 aa30.51■■■□□ 2.47
CTDNEP1-208ENST00000573600 GBP1P32455 592 aa30.51■■■□□ 2.47
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRADDQ15628 312 aa30.51■■■□□ 2.47
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC142Q17RM4 750 aa30.51■■■□□ 2.47
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KRT222Q8N1A0 295 aa30.51■■■□□ 2.47
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM171BQ6P995 826 aa30.5■■■□□ 2.47
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ATL2Q8NHH9 583 aa30.5■■■□□ 2.47
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HSF2BPO75031 334 aa30.48■■■□□ 2.47
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ECHS1P30084 290 aa30.48■■■□□ 2.47
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