RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 NINJ2Q9NZG7 142 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHGB4Q9UN71 923 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 GJB1P08034 283 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PON1P27169 355 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PGM1P36871 562 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PSEN2P49810 448 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 MTTPP55157 894 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 SOX10P56693 466 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 LMNB2Q03252 620 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 KCNA10Q16322 511 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ODR4Q5SWX8 454 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 LPCAT4Q643R3 524 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 RASSF3Q86WH2 238 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 CFAP61Q8NHU2 1237 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 NLRP7Q8WX94 980 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 BHMT2Q9H2M3 363 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 NDE1Q9NXR1 346 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 HTR3EA5X5Y0 456 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 BUD23O43709 281 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 HAUS5O94927 633 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ASGR1P07306 291 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 CYP2C9P11712 490 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 MUTP22033 750 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 COILP38432 576 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 CETN2P41208 172 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 NPEPPSP55786 919 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PRKCEQ02156 737 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 MFSD10Q14728 455 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PDK4Q16654 411 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 MAPK6Q16659 721 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 RFFLQ8WZ73 363 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ALG6Q9Y672 507 aa10.55□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 SMIM18P0DKX4 95 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 RAG1P15918 1043 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ICAM3P32942 547 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PIK3CAP42336 1068 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 OR6Y1Q8NGX8 325 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 NSL1Q96IY1 281 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R16BQ96T49 567 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 TUFT1Q9NNX1 390 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 MOXD2PA6NHM9 499 aa10.54□□□□□ -0.72
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TRPS1-211ENST00000520276 PRKCIP41743 596 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 AQP4P55087 323 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 BFSP2Q13515 415 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 GRM2Q14416 872 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 RNF111Q6ZNA4 994 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC43Q8N309 656 aa10.54□□□□□ -0.72
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TRPS1-211ENST00000520276 ZFP28Q8NHY6 868 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM39AQ9NV64 488 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 SGPL1O95470 568 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 BTKQ06187 659 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 COASYQ13057 564 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 MED21Q13503 144 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 SPARCL1Q14515 664 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 GRAMD4Q6IC98 578 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 FBXL19Q6PCT2 694 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC80Q76M96 950 aa10.54□□□□□ -0.72
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TRPS1-211ENST00000520276 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 MAML1Q92585 1016 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 NLRP4Q96MN2 994 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGEF4Q9NR80 690 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 LGALS13Q9UHV8 139 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 Q9Y3F1 56 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 NFASCO94856 1347 aa10.54□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PORP16435 677 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 YWHABP31946 246 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 HALP42357 657 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 RXRGP48443 463 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 CLK2P49760 499 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 NCOA4Q13772 614 aa10.53□□□□□ -0.72
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