RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 SNX18Q96RF0 628 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 PSMD9O00233 223 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 PPP6CO00743 305 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 ADAMTS3O15072 1205 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CCP110O43303 1012 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 BRAFP15056 766 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 FMO1Q01740 532 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 NEK8Q86SG6 692 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF778Q96MU6 729 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 ASB2Q96Q27 587 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 A6NNZ2 444 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 AP4M1O00189 453 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 TSPAN6O43657 245 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 PDE8BO95263 885 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CYP2D6P10635 497 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 MYF5P13349 255 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 KLRC1P26715 233 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 EPHB2P29323 1055 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 MPGP29372 298 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 E2F1Q01094 437 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 CEP78Q5JTW2 689 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF425Q6IV72 752 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 PRR25Q96S07 402 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 RNF7Q9UBF6 113 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 AMFRQ9UKV5 643 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 USP22Q9UPT9 525 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-221ENST00000514231 M0R3H8 397 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 EXOC3O60645 756 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 PMPCBO75439 489 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 VNN1O95497 513 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 FGAP02671 866 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 EPHA3P29320 983 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 GKP32189 559 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 NPY5RQ15761 445 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF626Q68DY1 528 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 C8orf58Q8NAV2 365 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 APIPQ96GX9 242 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 CIPCQ9C0C6 399 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 GOLIM4O00461 696 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 RASSF9O75901 435 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 ZBED1O96006 694 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 UQCRC1P31930 480 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 ARHGEF7Q14155 803 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 FCRL6Q6DN72 434 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 DNAJB14Q8TBM8 379 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 RITA1Q96K30 269 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 COL20A1Q9P218 1284 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 RGS10O43665 173 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 RASAL1O95294 804 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 TIRAPP58753 221 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 KRTAP10-11P60412 298 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 GBX1Q14549 363 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms