RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489537.5

SF3A3-208, Transcript of splicing factor 3a subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene SF3A3, Length 891 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3-208ENST00000489537 SIX4Q9UIU6 781 aa6.7□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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SF3A3-208ENST00000489537 PTPRJQ12913 1337 aa6.7□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.69□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.69□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 O00370 1275 aa6.69□□□□□ -1.34
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SF3A3-208ENST00000489537 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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SF3A3-208ENST00000489537 ACTN2P35609 894 aa6.68□□□□□ -1.34
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SF3A3-208ENST00000489537 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 NDST1P52848 882 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 AIF1P55008 147 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 RAB15P59190 212 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 RELBQ01201 579 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 PDCLQ13371 301 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 BFSP2Q13515 415 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 LRRC26Q2I0M4 334 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.342e-7■□□□□ 10.8
SF3A3-208ENST00000489537 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 TMEM110Q86TL2 294 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 HOOK3Q86VS8 718 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 CEP120Q8N960 986 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 CXorf38Q8TB03 319 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 TEKT4Q8WW24 435 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 IFT81Q8WYA0 676 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 ALG3Q92685 438 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 EXOC4Q96A65 974 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 MS4A14Q96JA4 679 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 CCDC77Q9BR77 488 aa6.68□□□□□ -1.34
SF3A3-208ENST00000489537 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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