RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 DESP17661 470 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 GJC1P36383 396 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 FLT3P36888 993 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 CACNA2D1P54289 1103 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 EFHC1Q5JVL4 640 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF280DQ6N043 979 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 MMGT1Q8N4V1 131 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 ZMIZ2Q8NF64 920 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
HOXB3-210ENST00000489475 KRIT1O00522 736 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 TKTL1P51854 596 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 SLC39A12Q504Y0 691 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 AADACL2Q6P093 401 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 ARCQ7LC44 396 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 KATNAL2Q8IYT4 538 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM30AQ9NV96 361 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 OR6C75A6NL08 312 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 LRCH4O75427 683 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 HADHQ16836 314 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC70Q6NSX1 233 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 TRNP1Q6NT89 227 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 OTOP2Q7RTS6 562 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 FBXO21O94952 628 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 OR4Q2P0C623 313 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 TCF4P15884 667 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 SDC4P31431 198 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 B3GALT6Q96L58 329 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 AP1M1Q9BXS5 423 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 DPYSL4O14531 572 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 RHOXF2BP0C7M4 288 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 ADCY1Q08828 1119 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 POLNQ7Z5Q5 900 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 EXD1Q8NHP7 514 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 RHOXF2Q9BQY4 288 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 TTPALQ9BTX7 342 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 PCDH10Q9P2E7 1040 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 H7C4K7 107 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 NDUFV1P49821 464 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC14Q49A88 953 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 RAB41Q5JT25 222 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 CFAP57Q96MR6 1250 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 CNGB3Q9NQW8 809 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 VWA8A3KMH1 1905 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 HHLA1C9JL84 531 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC188H7C350 402 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 HSF2BPO75031 334 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 KRT7P08729 469 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 PCK1P35558 622 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 RABGGTBP53611 331 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 FPGSQ05932 587 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 ODF2Q5BJF6 829 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 KCNT2Q6UVM3 1135 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 ANKS3Q6ZW76 656 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC50Q8IVM0 306 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 BADQ92934 168 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 FAM149B1Q96BN6 582 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 EPC1Q9H2F5 836 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 PNPLA8Q9NP80 782 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 COL4A6Q14031 1691 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 SART1O43290 800 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 FGBP02675 491 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 CETN2P41208 172 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 RCOR2Q8IZ40 523 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 IGSF21Q96ID5 467 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF558Q96NG5 402 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 ULBP1Q9BZM6 244 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 ZBBXA8MT70 800 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 GLI1P08151 1106 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 MIPP30301 263 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 ATP11AP98196 1134 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 CDO1Q16878 200 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 RTP2Q5QGT7 225 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXB3-210ENST00000489475 C16orf59Q7L2K0 433 aa28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms