RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	CKM	P06732	381 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	TDGF1	P13385	188 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CNR2	P34972	360 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CXCL12	P48061	93 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	TUB	P50607	506 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	DLG4	P78352	724 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	INCA1	Q0VD86	236 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	NR1H3	Q13133	447 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO43	Q4G163	708 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP2A3	Q93084	1043 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP63	Q96MT8	703 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL26	Q9Y258	94 aa		18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	ATG13	O75143	517 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CLSTN1	O94985	981 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	GNA14	O95837	355 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	DRD1	P21728	446 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	MTF1	Q14872	753 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC142	Q17RM4	750 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT39	Q6A163	491 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CPA6	Q8N4T0	437 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	EPC1	Q9H2F5	836 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	HPS4	Q9NQG7	708 aa		18.34	■□□□□ 0.53
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFRSF10B	O14763	440 aa		18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-DRA	P01903	254 aa		18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	BMP6	P22004	513 aa		18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	YWHAQ	P27348	245 aa		18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CDR1	P51861	262 aa		18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CDH8	P55286	799 aa		18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	STKLD1	Q8NE28	680 aa		18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	RUBCN	Q92622	972 aa		18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424		R4GN57	208 aa		18.33	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ASPA	P45381	313 aa		18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	USP46	P62068	366 aa		18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TNK2	Q07912	1038 aa		18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM35A	Q86V20	835 aa		18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	OTUB2	Q96DC9	234 aa		18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ECT2	Q9H8V3	914 aa		18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf78	A6NCI8	922 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	NFATC1	O95644	943 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	PIK3CA	P42336	1068 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNAR2	P48551	515 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP3CA	Q08209	521 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TAF10	Q12962	218 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	EML3	Q32P44	896 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	FUK	Q8N0W3	1084 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC22A12	Q96S37	553 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SDCBP2	Q9H190	292 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	EBF3	Q9H4W6	596 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ANO10	Q9NW15	660 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		18.31	■□□□□ 0.52

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