RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBM34-208	ENST00000485019	MYO7A	Q13402	2215 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	HHLA1	C9JL84	531 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TULP2	O00295	520 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	LAMP2	P13473	410 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	CYP11B1	P15538	503 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	RGS7	P49802	495 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	JAM2	P57087	298 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ARID5A	Q03989	594 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TRIM5	Q9C035	493 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	CEP83	Q9Y592	693 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	CFH	P08603	1231 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	CCDC172	P0C7W6	258 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	LCP1	P13796	627 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	PBX1	P40424	430 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	PLA2G4A	P47712	749 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	PPP3CC	P48454	512 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TKTL1	P51854	596 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	KIF11	P52732	1056 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	PKDCC	Q504Y2	493 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TXNDC8	Q6A555	127 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	PASD1	Q8IV76	773 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	GJD3	Q8N144	294 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TASP1	Q9H6P5	420 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ST7	Q9NRC1	585 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	GDE1	Q9NZC3	331 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26	7e-10	■□□□□ 10.5
RBM34-208	ENST00000485019	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	LRRC53	A6NM62	1247 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	PIK3R2	O00459	728 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	FER	P16591	822 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	GPD2	P43304	727 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ADIG	Q0VDE8	80 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ASIC2	Q16515	512 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	MEA1	Q16626	185 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	FIGN	Q5HY92	759 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	PMF1	Q6P1K2	205 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	HSFY1	Q96LI6	401 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	IL37	Q9NZH6	218 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	GMIP	Q9P107	970 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	MYO6	Q9UM54	1294 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	SCML2	Q9UQR0	700 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	COL6A3	P12111	3177 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	DPYSL4	O14531	572 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TADA3	O75528	432 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	MME	P08473	750 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	USP17L7	P0C7H9	530 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	AVPR1A	P37288	418 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	RAB41	Q5JT25	222 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	SARM1	Q6SZW1	724 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	MTSS1L	Q765P7	747 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	MON1A	Q86VX9	555 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF677	Q86XU0	584 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	BAP1	Q92560	729 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	SMARCD2	Q92925	531 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	IQCD	Q96DY2	449 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM34-208	ENST00000485019	NOX5	Q96PH1	765 aa		13.42	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms