RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 RIN3Q8TB24 985 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 OVCA2Q8WZ82 227 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 FBXO32Q969P5 355 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D17Q9HA65 648 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 HEBP1Q9NRV9 189 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 ANO10Q9NW15 660 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 PI15O43692 258 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 USP17L7P0C7H9 530 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 PFKLP17858 780 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 HDCP19113 662 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 SLC9A1P19634 815 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 CLCN5P51795 746 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 PRKCQQ04759 706 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 TMEM270Q6UE05 265 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 SHDQ96IW2 340 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.14■■□□□ 1.14
ACTB-211ENST00000480301 SHISA7A6NL88 538 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 VDRP11473 427 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 AOC1P19801 751 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 SGO2Q562F6 1265 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 MIIPQ5JXC2 388 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 GBP6Q6ZN66 633 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 RNF38Q9H0F5 515 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 GMIPQ9P107 970 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 KCNJ18B7U540 433 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 STK25O00506 426 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 OLFM2O95897 454 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 ABL1P00519 1130 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 CKMP06732 381 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 PAEPP09466 180 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 CD19P15391 556 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 KCNJ12Q14500 433 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 STX1AQ16623 288 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 VWA3BQ502W6 1294 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 TTC30AQ86WT1 665 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 TFAP2BQ92481 460 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 NDST4Q9H3R1 872 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 COL4A3Q01955 1670 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 KANSL1LA0AUZ9 987 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 PON1P27169 355 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 PGFP49763 221 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 PDE6CP51160 858 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 KIF11P52732 1056 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 ZNF132P52740 706 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 SLC7A9P82251 487 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 ZXDBP98169 803 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 PLCB2Q00722 1185 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 APBA1Q02410 837 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 ZNF77Q15935 545 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 GJB7Q6PEY0 223 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 TPRG1Q6ZUI0 275 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 FOXQ1Q9C009 403 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 SCML2Q9UQR0 700 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 USP3Q9Y6I4 520 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 O00370 1275 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 TCF3P15923 654 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 CD72P21854 359 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ACTB-211ENST00000480301 USP4Q13107 963 aa22.11■■□□□ 1.13
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