RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477373.1

ZYX-209, Transcript of zyxin, human

TSL 4

Gene ZYX, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZYX-209	ENST00000477373	SOD2	P04179	222 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	LCP1	P13796	627 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	SYN1	P17600	705 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	BDNF	P23560	247 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	CXCR5	P32302	372 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	MAGEA11	P43364	429 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	MARCKSL1	P49006	195 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	TAS2R40	P59535	323 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	ITIH3	Q06033	890 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	ADIG	Q0VDE8	80 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	SMARCB1	Q12824	385 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	GPR17	Q13304	367 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	EMC1	Q8N766	993 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	KCNK16	Q96T55	309 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	SLC9A7	Q96T83	725 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	PSMB7	Q99436	277 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	MTRR	Q9UBK8	725 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	GBF1	Q92538	1859 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	TNFRSF10B	O14763	440 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	TADA3	O75528	432 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	GLI1	P08151	1106 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	GPD1	P21695	349 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	PSMA2	P25787	234 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	FLT3	P36888	993 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	PTPN9	P43378	593 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	NDUFV1	P49821	464 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	TKTL1	P51854	596 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	RABGGTB	P53611	331 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	DAOA	P59103	153 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	DSG1	Q02413	1049 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	TAF5	Q15542	800 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	LRRC38	Q5VT99	294 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	VSTM1	Q6UX27	236 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	CEP57	Q86XR8	500 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	GPR65	Q8IYL9	337 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	C8orf48	Q96LL4	319 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	YME1L1	Q96TA2	773 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	CNPY3	Q9BT09	278 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	SPG21	Q9NZD8	308 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	EHD2	Q9NZN4	543 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	INSL6	Q9Y581	213 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	USP3	Q9Y6I4	520 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	MTMR11	A4FU01	709 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	HSF2BP	O75031	334 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	LRCH4	O75427	683 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	DAB1	O75553	588 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	TCF4	P15884	667 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	PDGFRA	P16234	1089 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	CYP2F1	P24903	491 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	PCK1	P35558	622 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	PPM1A	P35813	382 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	DNA2	P51530	1060 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	CDR1	P51861	262 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	RWDD2B	P57060	319 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	PSMD5	Q16401	504 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	CCDC14	Q49A88	953 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	BNIPL	Q7Z465	357 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	FIBCD1	Q8N539	461 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	MNS1	Q8NEH6	495 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZYX-209	ENST00000477373	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		11.37	□□□□□ -0.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms