RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 RAB20Q9NX57 234 aa20■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 FBXO4Q9UKT5 387 aa20■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa20■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 DMDP11532 3685 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNFRSF10BO14763 440 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 LAMTOR5O43504 91 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 AP1G2O75843 785 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 SP9P0CG40 484 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 CD44P16070 742 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 HDCP19113 662 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 BMP6P22004 513 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 YWHAQP27348 245 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC5A3P53794 718 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRRC32Q14392 662 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF528Q3MIS6 628 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 TCERG1LQ5VWI1 586 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC35C1Q96A29 364 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 TWNKQ96RR1 684 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYP2S1Q96SQ9 504 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 HPS4Q9NQG7 708 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 GKN1Q9NS71 199 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM49BQ9NUQ9 324 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 COMMD8Q9NX08 183 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 BICDL2A1A5D9 508 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 GFRA3O60609 400 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 OAS1P00973 400 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHRNB1P11230 501 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 CD58P19256 250 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC7A9P82251 487 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 RUNX3Q13761 415 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 CBWD6Q4V339 395 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 WDR44Q5JSH3 913 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 CBWD3Q5JTY5 395 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 CBWD5Q5RIA9 395 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 ISM2Q6H9L7 571 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 TTI2Q6NXR4 508 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 TXNDC11Q6PKC3 985 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAMSTRQ6ZN01 415 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIAA1958Q8N8K9 716 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 C12orf29Q8N999 325 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 TTC8Q8TAM2 541 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 SH3RF2Q8TEC5 729 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 WHAMMQ8TF30 809 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 OSCP1Q8WVF1 389 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 FBXO32Q969P5 355 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 EBF3Q9H4W6 596 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 IL37Q9NZH6 218 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 COQ4Q9Y3A0 265 aa19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM92AA1XBS5 289 aa19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM200BP0CF97 657 aa19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 TUBP50607 506 aa19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 MTAPQ13126 283 aa19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRIM68Q6AZZ1 485 aa19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRIML1Q8N9V2 468 aa19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZMIZ2Q8NF64 920 aa19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 NELFBQ8WX92 580 aa19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATP2A3Q93084 1043 aa19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMOQ99835 787 aa19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 LMAN1LQ9HAT1 526 aa19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 CTNND2Q9UQB3 1225 aa19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRR23AA6NEV1 266 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADORA2BP29275 332 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 IFNAR2P48551 515 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 AMPD2Q01433 879 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 DGKKQ5KSL6 1271 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 SNX30Q5VWJ9 437 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 KLHL10Q6JEL2 608 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 CPA6Q8N4T0 437 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 SCAMP5Q8TAC9 235 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 SEMA4AQ9H3S1 761 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 FBXO44Q9H4M3 255 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 PNPLA8Q9NP80 782 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC10-208ENST00000469521 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC10-208ENST00000469521 BIN1O00499 593 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC10-208ENST00000469521 BEST1O76090 585 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC10-208ENST00000469521 ABL1P00519 1130 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARSAP15289 507 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAP3K7CLP57077 242 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC10-208ENST00000469521 PAK1Q13153 545 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCINQ13939 588 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC10-208ENST00000469521 PON2Q15165 354 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC10-208ENST00000469521 CLEC20AQ6ZU45 233 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYFIP2Q96F07 1278 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARID3AQ99856 593 aa19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms