RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CAPN8A6NHC0 703 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAM23O75077 832 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP2D6P10635 497 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 NCKAP1LP55160 1127 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 EDRF1Q3B7T1 1238 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf183Q5T699 404 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ICA1LQ8NDH6 482 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC20A1Q8WUM9 679 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 USP6NLQ92738 828 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TMOD2Q9NZR1 351 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC17A7Q9P2U7 560 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 KLRF2D3W0D1 207 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CLIC2O15247 247 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 AP1G1O43747 822 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SORBS3O60504 671 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 LILRB3O75022 631 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC18A1P54219 525 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 VCPP55072 806 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GABPAQ06546 454 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PTK6Q13882 451 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT81Q14533 505 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GPBP1Q86WP2 473 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SFR1Q86XK3 245 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TCP10LQ8TDR4 215 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35C1Q96A29 364 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX27Q96L92 541 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP57Q96MR6 1250 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MTMR9Q96QG7 549 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB34Q9BZG1 259 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CNTNAP1P78357 1384 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PRQ8 180 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ADCY6O43306 1168 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CBFA2T3O75081 653 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 DLDP09622 509 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 KLRK1P26718 216 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINB6P35237 376 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 HSD17B7P56937 341 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CAV1Q03135 178 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GK3PQ14409 553 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ARSHQ5FYA8 562 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF410Q86VK4 478 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CASP10Q92851 521 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TEKT1Q969V4 418 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CNBD2Q96M20 576 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SYT11Q9BT88 431 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM17Q9Y577 477 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FADS3Q9Y5Q0 445 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PHIPQ8WWQ0 1821 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 STAMBPO95630 424 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 EPHB1P54762 984 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PFKPQ01813 784 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PACS1Q6VY07 963 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 NSMFQ6X4W1 530 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM83AQ86UY5 434 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF276Q8N554 614 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ERMNQ8TAM6 284 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHO2Q8TD55 490 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC5A5Q92911 643 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ERLEC1Q96DZ1 483 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 VAT1LQ9HCJ6 419 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf50Q9HD87 102 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNQ5Q9NR82 932 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SENP1Q9P0U3 644 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms