RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 A0A0G2JND7 137 aa20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 BCAR1P56945 870 aa20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 GPX6P59796 221 aa20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 BEX3Q00994 111 aa20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 ROR1Q01973 937 aa20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 GRIK4Q16099 956 aa20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 SLC17A7Q9P2U7 560 aa20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 HESX1Q9UBX0 185 aa20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.55■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 B4GALT4O60513 344 aa20.54■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 CILPO75339 1184 aa20.54■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 GPD1P21695 349 aa20.54■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.54■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 CROCCP2Q86T23 111 aa20.54■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.54■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 FITM2Q8N6M3 262 aa20.54■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 PAFAH2Q99487 392 aa20.54■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.54■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 TARSP26639 723 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 FAM131BQ86XD5 332 aa20.54■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 ERP27Q96DN0 273 aa20.54■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.54■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 CPA4Q9UI42 421 aa20.54■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 ZBED1O96006 694 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 KITP10721 976 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 P4HA1P13674 534 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 LMO2P25791 158 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 GPD2P43304 727 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 MFSD5Q6N075 450 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 KCNV2Q8TDN2 545 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 CKAP2Q8WWK9 683 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 RNF39Q9H2S5 420 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 RBP5P82980 135 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 CNPY4Q8N129 248 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.882e-6■□□□□ 9.3
TTLL3-210ENST00000427220 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 KBTBD13C9JR72 458 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 SDC4P31431 198 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 NME3Q13232 169 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 SNCBQ16143 134 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 UBR7Q8N806 425 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 SLCO2A1Q92959 643 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.53■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 C5orf60A6NFR6 353 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 CLDN5O00501 218 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 RARBP10826 455 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 GCAP28676 217 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 CLUHO75153 1309 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 CREB3O43889 395 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 TSPAN1O60635 241 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 TAC1P20366 129 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 SNAPC2Q13487 334 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 SPDYCQ5MJ68 293 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 RFX8Q6ZV50 586 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 TRABD2AQ86V40 505 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 PPIL6Q8IXY8 311 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.52■□□□□ 0.88
TTLL3-210ENST00000427220 ASB14A6NK59 587 aa20.51■□□□□ 0.87
TTLL3-210ENST00000427220 CXCL11O14625 94 aa20.51■□□□□ 0.87
TTLL3-210ENST00000427220 UGT1A9O60656 530 aa20.51■□□□□ 0.87
TTLL3-210ENST00000427220 SMPD1P17405 629 aa20.51■□□□□ 0.87
TTLL3-210ENST00000427220 GRIA1P42261 906 aa20.51■□□□□ 0.87
TTLL3-210ENST00000427220 DPYSL3Q14195 570 aa20.51■□□□□ 0.87
TTLL3-210ENST00000427220 CCNYQ8ND76 341 aa20.51■□□□□ 0.87
TTLL3-210ENST00000427220 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TTLL3-210ENST00000427220 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.51■□□□□ 0.87
TTLL3-210ENST00000427220 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.51■□□□□ 0.87
TTLL3-210ENST00000427220 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.51■□□□□ 0.87
TTLL3-210ENST00000427220 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.51■□□□□ 0.87
TTLL3-210ENST00000427220 HAO1Q9UJM8 370 aa20.51■□□□□ 0.87
TTLL3-210ENST00000427220 MT-ND3P03897 115 aa20.51■□□□□ 0.87
TTLL3-210ENST00000427220 CTSHP09668 335 aa20.51■□□□□ 0.87
TTLL3-210ENST00000427220 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.8 ms