RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 DCLK1O15075 740 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 FFAR2O15552 330 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 PROM1O43490 865 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 CSTBP04080 98 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 MYL4P12829 197 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 IL1R2P27930 398 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 BLMHQ13867 455 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ELF2Q15723 593 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 KIAA0895LQ68EN5 471 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 TAPT1Q6NXT6 567 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ZDHHC24Q6UX98 284 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 MICALCLQ6ZW33 695 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 GAS2L3Q86XJ1 694 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ADGRG5Q8IZF4 528 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 CFAP52Q8N1V2 620 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF527Q8NB42 609 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 SLC30A5Q8TAD4 765 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF384Q8TF68 577 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 C18orf8Q96DM3 657 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 PGBD1Q96JS3 809 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 UROC1Q96N76 676 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 TRIB1Q96RU8 372 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 MESP1Q9BRJ9 268 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 KLK15Q9H2R5 256 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 TM7SF3Q9NS93 570 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 MID2Q9UJV3 735 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 CAPN11Q9UMQ6 739 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 FAM234BA2RU67 622 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 E7ENX8 843 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 CCP110O43303 1012 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 KCNQ3O43525 872 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 TLR5O60602 858 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 PROP1O75360 226 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 RASSF9O75901 435 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 SUN1O94901 812 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 A1BGP04217 495 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 CYP2C9P11712 490 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 GATA3P23771 443 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 LMO1P25800 156 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ACVR2AP27037 513 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 GABRB3P28472 473 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 GRIA3P42263 894 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 MC2RQ01718 297 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 NHLH1Q02575 133 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 TAP2Q03519 686 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 PTPRRQ15256 657 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC38Q502W7 563 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 COLEC12Q5KU26 742 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 RRAGBQ5VZM2 374 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 KRT28Q7Z3Y7 464 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 YAF2Q8IY57 180 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 CPXCR1Q8N123 301 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 SPATA5Q8NB90 893 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 POC1BQ8TC44 478 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 TFAP2BQ92481 460 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 CCT6BQ92526 530 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 LPIN2Q92539 896 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 LRIG1Q96JA1 1093 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 SLC46A1Q96NT5 459 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 MOGAT1Q96PD6 335 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 NECTIN3Q9NQS3 549 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 TBC1D23Q9NUY8 699 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ASB6Q9NWX5 421 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 HDAC9Q9UKV0 1011 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 SLC39A10Q9ULF5 831 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 NPC1O15118 1278 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 VPS4BO75351 444 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 INMTO95050 263 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 NDST3O95803 873 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 CHRM2P08172 466 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 CDK4P11802 303 aa3.43□□□□□ -1.86
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