RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 CYLDQ9NQC7 956 aa22.64■■□□□ 1.21
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SH3BP5-204ENST00000412806 ARVCFO00192 962 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5-204ENST00000412806 CD48P09326 243 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP5-204ENST00000412806 GRIK3Q13003 919 aa22.63■■□□□ 1.21
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SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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SH3BP5-204ENST00000412806 VPS18Q9P253 973 aa22.62■■□□□ 1.21
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SH3BP5-204ENST00000412806 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.59■■□□□ 1.21
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SH3BP5-204ENST00000412806 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
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SH3BP5-204ENST00000412806 PTPRDP23468 1912 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5-204ENST00000412806 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5-204ENST00000412806 ENDOD1O94919 500 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP5-204ENST00000412806 PTPN9P43378 593 aa22.58■■□□□ 1.21
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