RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 CDYLQ9Y232 598 aa17.85■□□□□ 0.45
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SH3BP4-202ENST00000392011 DLG4P78352 724 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 MFSD7Q6UXD7 560 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 PRUNE1Q86TP1 453 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 GALNT4Q8N4A0 578 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 REPS2Q8NFH8 660 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM136AQ96C01 138 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNMB3Q9NPA1 279 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 UBP1Q9NZI7 540 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 WNT7AO00755 349 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP17.83■□□□□ 0.447e-7■■□□□ 13.6
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SH3BP4-202ENST00000392011 RPL21P46778 160 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 BMPR2Q13873 1038 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 MKL1Q969V6 931 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 CEP41Q9BYV8 373 aa17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 SUPT7LO94864 414 aa17.83■□□□□ 0.44
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