RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 LIN52Q52LA3 116 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MZT2AQ6P582 158 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 OR6S1Q8NH40 331 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC138Q96M89 665 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 OPALINQ96PE5 141 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MTRRQ9UBK8 725 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CAPN11Q9UMQ6 739 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 DLEC1Q9Y238 1755 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 OR6B1O95007 311 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GCP02774 474 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PROCP04070 461 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ZCCHC18P0CG32 403 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PCSK2P16519 638 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 HCAR3P49019 387 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 BCAP31P51572 246 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 DSC2Q02487 901 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GRB10Q13322 594 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 QPCTQ16769 361 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP85Q6P2H3 762 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CAMK1GQ96NX5 476 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 HPSEQ9Y251 543 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MAGEB16A2A368 324 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TISP43B9A030 160 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 B9A039 149 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 AKAP10O43572 662 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GNAZP19086 355 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CMA1P23946 247 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT76Q01546 638 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 BMPR2Q13873 1038 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT24Q2M2I5 525 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CNTD1Q8N815 330 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 FSIP1Q8NA03 581 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 ST8SIA2Q92186 375 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHA12Q9UN75 941 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BQV1 296 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 GFAPP14136 432 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP6V1B1P15313 513 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 PHBP35232 272 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 ADH7P40394 386 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 CAPZA2P47755 286 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 NCF4Q15080 339 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TLR1Q15399 786 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SUSD1Q6UWL2 747 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MED16Q9Y2X0 877 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PP64 1363 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 MRC1P22897 1456 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM23A6NLE4 172 aa7.1□□□□□ -1.27
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