RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 CDH9Q9ULB4 789 aa25.5■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 EFR3BQ9Y2G0 817 aa25.5■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 CLDN5O00501 218 aa25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 LCP1P13796 627 aa25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 GBP1P32455 592 aa25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 BFSP2Q13515 415 aa25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 GLB1LQ6UWU2 654 aa25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 CD300LGQ6UXG3 332 aa25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 ARCQ7LC44 396 aa25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 ATL2Q8NHH9 583 aa25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 CFAP57Q96MR6 1250 aa25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 SNX24Q9Y343 169 aa25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 H3BQF6 201 aa25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 SDC4P31431 198 aa25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 PPP1R7Q15435 360 aa25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 PIGZQ86VD9 579 aa25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 CLEC4CQ8WTT0 213 aa25.49■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 CYP11A1P05108 521 aa25.48■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 KDELR1P24390 212 aa25.48■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 PCSK1P29120 753 aa25.48■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 OAS2P29728 719 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 RPL21P46778 160 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 TAZQ16635 292 aa25.48■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 PEBP4Q96S96 227 aa25.48■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 MED10Q9BTT4 135 aa25.48■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa25.48■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 GRHL1Q9NZI5 618 aa25.48■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 GOLGA6BA6NDN3 693 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 M0QZQ0 153 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 DESP17661 470 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 KRT17Q04695 432 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 ALS2CLQ60I27 953 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 CLEC20AQ6ZU45 233 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 KCTD13Q8WZ19 329 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 DEFB118Q96PH6 123 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 MED4Q9NPJ6 270 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 I3L4J1 428 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 BEST1O76090 585 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 GAS8O95995 478 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 FAM200BP0CF97 657 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 BRCC3P46736 316 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 ATP11AP98196 1134 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 MTFR1Q15390 333 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 CDO1Q16878 200 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 CLLU1OSQ5K130 101 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 METTL23Q86XA0 190 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 KCTD6Q8NC69 237 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 LRRC45Q96CN5 670 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 FMO2Q99518 471 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 NCAPGQ9BPX3 1015 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 DSEQ9UL01 958 aa25.47■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 MYBPHLA2RUH7 354 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 AGPSO00116 658 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 PRPSAP2O60256 369 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 PTPN9P43378 593 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 RAB6CQ53S08 254 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 HSP90B2PQ58FF3 399 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 ZDHHC24Q6UX98 284 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 FAM172AQ8WUF8 416 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 RSPH1Q8WYR4 309 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 HSPH1Q92598 858 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 FAM118BQ9BPY3 351 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 RTP3Q9BQQ7 232 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 RAB6CQ9H0N0 254 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 OGDHLQ9ULD0 1010 aa25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 LIASO43766 372 aa25.45■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 NBNO60934 754 aa25.45■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 MYCP01106 439 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 PTK6Q13882 451 aa25.45■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 NOMO2Q5JPE7 1267 aa25.45■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 EFHC1Q5JVL4 640 aa25.45■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 FAM35AQ86V20 835 aa25.45■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 URGCPQ8TCY9 931 aa25.45■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 HASPINQ8TF76 798 aa25.45■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 ZBTB9Q96C00 473 aa25.45■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 PCED1BQ96HM7 432 aa25.45■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC114Q96M63 670 aa25.45■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 ACBD6Q9BR61 282 aa25.45■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 KRT82Q9NSB4 513 aa25.45■■□□□ 1.67
SERF1B-201ENST00000380750 HSF2BPO75031 334 aa25.45■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 GGCXP38435 758 aa25.45■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 PLTPP55058 493 aa25.45■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 ADIGQ0VDE8 80 aa25.45■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 GPNMBQ14956 572 aa25.45■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 SUSD3Q96L08 255 aa25.45■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 ARHGEF37A1IGU5 675 aa25.44■■□□□ 1.66
SERF1B-201ENST00000380750 PITPNM1O00562 1244 aa25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms