RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378707.7

DMD-211, Transcript of dystrophin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene DMD, Length 7,410 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMD-211ENST00000378707 PTPRHQ9HD43 1115 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 MAGEB3O15480 346 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 TFRCP02786 760 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 PDGFRBP09619 1106 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 BMP3P12645 472 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 HALP42357 657 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 CHN2P52757 468 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 MTM1Q13496 603 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 TMEM132BQ14DG7 1078 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 TTLL9Q3SXZ7 439 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 CACUL1Q86Y37 369 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 CD209Q9NNX6 404 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 SOAT2O75908 522 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 TDP2O95551 362 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 ASNSP08243 561 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 ZCCHC18P0CG32 403 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 CDC25AP30304 524 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 OR1G1P47890 313 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 PYDC2Q56P42 97 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 TRABDQ9H4I3 376 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 ZMYM6O95789 1325 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 ITGA1P56199 1179 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 PPP2R2BQ00005 443 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 C10orf120Q5SQS8 335 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 FATE1Q969F0 183 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 COL26A1Q96A83 441 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 BNC1Q01954 994 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 UGP2Q16851 508 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 TMEM26Q6ZUK4 368 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 HIC2Q96JB3 615 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 RMDN3Q96TC7 470 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 CYP3A43Q9HB55 503 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa7.06□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 NR5A2O00482 541 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 DMTNQ08495 405 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 TRAF3Q13114 568 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 LAMB3Q13751 1172 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 SNX17Q15036 470 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 CYP20A1Q6UW02 462 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 OLFML1Q6UWY5 402 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 ACOX2Q99424 681 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 ASPRV1Q53RT3 343 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 IRGCQ6NXR0 463 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 ZNF790Q6PG37 636 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 UCMAQ8WVF2 138 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 POLD4Q9HCU8 107 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 PCDHA4Q9UN74 947 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 AGAP1Q9UPQ3 857 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 MCIDASD6RGH6 385 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 SLC16A4O15374 487 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 SH3BGRLO75368 114 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 VPS26AO75436 327 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 KLHL2O95198 593 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 HOXC12P31275 282 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 PRR5LQ6MZQ0 368 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 NLRP10Q86W26 655 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 OR2L3Q8NG85 312 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 DNAJC9Q8WXX5 260 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 SLC12A4Q9UP95 1085 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 HFM1A2PYH4 1435 aa7.05□□□□□ -1.28
DMD-211ENST00000378707 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms