RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 LHX8Q68G74 356 aa13.65□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 GLB1LQ6UWU2 654 aa13.65□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 GSTA5Q7RTV2 222 aa13.65□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATG4AQ8WYN0 398 aa13.65□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 RAPGEF5Q92565 580 aa13.65□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 NEUROG2Q9H2A3 272 aa13.65□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 LRRC4Q9HBW1 653 aa13.65□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 RGS18Q9NS28 235 aa13.65□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 MIOSQ9NXC5 875 aa13.65□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 VPS18Q9P253 973 aa13.65□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 PCSK1NQ9UHG2 260 aa13.65□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa13.65□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 CASTOR2A6NHX0 329 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 INPPL1O15357 1258 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 LIASO43766 372 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 RNF40O75150 1001 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 FBXO21O94952 628 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRT10P13645 584 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 LCP1P13796 627 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 NPR3P17342 541 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 FLT3P36888 993 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 PLCB3Q01970 1234 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 TFDP2Q14188 446 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRT81Q14533 505 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 PDK2Q15119 407 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 UPP1Q16831 310 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 MDH1BQ5I0G3 518 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 BBS12Q6ZW61 710 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMC3Q7Z5M5 1100 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 VSIG1Q86XK7 387 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 RFX6Q8HWS3 928 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 TEKT4Q8WW24 435 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 KCTD13Q8WZ19 329 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 HSPH1Q92598 858 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 ART4Q93070 314 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZIM3Q96PE6 472 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 HERPUD2Q9BSE4 406 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRPV6Q9H1D0 765 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 GRHL1Q9NZI5 618 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRIM17Q9Y577 477 aa13.64□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 TULP2O00295 520 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 HCRTO43612 131 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 PPFIA2O75334 1257 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 DAB1O75553 588 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 GRAP2O75791 330 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 SYF2O95926 243 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 POMCP01189 267 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRT14P02533 472 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 COL6A1P12109 1028 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 SELPP16109 830 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 IL1R2P27930 398 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 HSD17B3P37058 310 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADCY8P40145 1251 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 VCPP55072 806 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 TAZQ16635 292 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 CDO1Q16878 200 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMTNL2Q2TAL5 461 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC14Q49A88 953 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZDHHC24Q6UX98 284 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC24A5Q71RS6 500 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 LRRC8DQ7L1W4 858 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 CROCCP2Q86T23 111 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 SCUBE3Q8IX30 993 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 FUKQ8N0W3 1084 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 IQCKQ8N0W5 287 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 THEM5Q8N1Q8 247 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM172AQ8WUF8 416 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 SH3GL2Q99962 352 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 LPIN3Q9BQK8 851 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 FOXP3Q9BZS1 431 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRT82Q9NSB4 513 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 KANSL3Q9P2N6 904 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF148Q9UQR1 794 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 PLAAQ9Y263 795 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAN1Q9Y2M0 1017 aa13.63□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 AGPSO00116 658 aa13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms