RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362913.1

SNORD56.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 68 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.1-201ENST00000362913 PEX1O43933 1283 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 NTSR2O95665 410 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 NDST3O95803 873 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 PRKCBP05771 671 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 HKR1P10072 659 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 PPP3CBP16298 524 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 UQCRC1P31930 480 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 MTHFSP49914 203 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 GATMP50440 423 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 PGDP52209 483 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 ATP1A4Q13733 1029 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 BMPR2Q13873 1038 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 SPARCL1Q14515 664 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 PFKFB4Q16877 469 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 KIAA0895LQ68EN5 471 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 MTHFD1LQ6UB35 978 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 CRTC1Q6UUV9 634 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 RINLQ6ZS11 566 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 RFX8Q6ZV50 586 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 MRGPREQ86SM8 312 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 SKAP1Q86WV1 359 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 GATAD2AQ86YP4 633 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 LCORLQ8N3X6 602 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 ANKRD42Q8N9B4 389 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC30A5Q8TAD4 765 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 DNAJB14Q8TBM8 379 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 SOCS4Q8WXH5 440 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 ATG4AQ8WYN0 398 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 CCT6BQ92526 530 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 PBKQ96KB5 322 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 RMDN3Q96TC7 470 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 VN1R3Q9BXE9 311 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 PCDHAC1Q9H158 963 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 MYLK2Q9H1R3 596 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC25A32Q9H2D1 315 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 GLOD4Q9HC38 313 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 CASS4Q9NQ75 786 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 RXFP3Q9NSD7 469 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 VPS51Q9UID3 782 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 MAST3O60307 1309 aa3.09□□□□□ -1.91
SNORD56.1-201ENST00000362913 COL15A1P39059 1388 aa3.09□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 UNC119BA6NIH7 251 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZAR1LA6NP61 321 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 BTBD11A6QL63 1104 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 PSMD9O00233 223 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 NPC1O15118 1278 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 PPM1DO15297 605 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 YY2O15391 372 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 ORC4O43929 436 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 VIPP01282 170 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 DLDP09622 509 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 ITGAMP11215 1152 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 NPPBP16860 134 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 MST1P26927 711 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 CHKAP35790 457 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 SERPINF1P36955 418 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 HALP42357 657 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 CCT5P48643 541 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 TIRAPP58753 221 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 GPS1Q13098 491 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 RAPGEF1Q13905 1077 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRIM14Q14142 442 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 KCNAB1Q14722 419 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 ELF2Q15723 593 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 ST3GAL2Q16842 350 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 PTCHD3Q3KNS1 767 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 TMEM95Q3KNT9 176 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 PLAC9Q5JTB6 97 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 TMEM63BQ5T3F8 832 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 RAP1GAP2Q684P5 730 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 TANGO2Q6ICL3 276 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 TTC30AQ86WT1 665 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 CERS3Q8IU89 383 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 ASB10Q8WXI3 467 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 PPM1EQ8WY54 764 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 LPIN2Q92539 896 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRIM63Q969Q1 353 aa3.08□□□□□ -1.92
SNORD56.1-201ENST00000362913 FKBP10Q96AY3 582 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms