RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 TLR9Q9NR96 1032 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPG21Q9NZD8 308 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 LZTS1Q9Y250 596 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 HPSEQ9Y251 543 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 GDAQ9Y2T3 454 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 VCANP13611 3396 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A1B0GVL5 298 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 F8W810 466 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 NRP1O14786 923 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRRN2O75325 713 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 TOM1L1O75674 476 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 MCF2P10911 925 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 IDEP14735 1019 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 PFKFB1P16118 471 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 SCP2P22307 547 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 CASP1P29466 404 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 CASP5P51878 434 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 OSTNP61366 133 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 MCL1Q07820 350 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 HYAL1Q12794 435 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 GRIK3Q13003 919 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 NAB2Q15742 525 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 XKR4Q5GH76 650 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC17A8Q8NDX2 589 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 BICD1Q96G01 975 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 VN1R3Q9BXE9 311 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM9Q9C026 710 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 IKZF4Q9H2S9 585 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAGEF1Q9HAY2 307 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 PANK4Q9NVE7 773 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 MARCH5Q9NX47 278 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D7Q9P0N9 293 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 CACNG4Q9UBN1 327 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM59LQ9UK28 342 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A0B4J269 797 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A1W2PQ27 194 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A1W2PQ64 194 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A1W2PQD8 194 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 HIDE1A8MVS5 230 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 TISP43B9A030 160 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLDN3O15551 220 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM189A1O60320 539 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 EFEMP2O95967 443 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 ALDH2P05091 517 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 THP07101 528 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 MYBP10242 640 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 GAP43P17677 238 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 ABCD1P33897 745 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR1G1P47890 313 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 LIG4P49917 911 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 NDUFA8P51970 172 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 AMPD3Q01432 767 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 TFF2Q03403 129 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 KRT17Q04695 432 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 EGR3Q06889 387 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 COASYQ13057 564 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 CUL4BQ13620 913 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 KCNMB1Q16558 191 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLPP4Q5VZY2 271 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC65Q8IXS2 484 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 RABGGTAQ92696 567 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 HPS3Q969F9 1004 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 HVCN1Q96D96 273 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM169Q96HH4 297 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 SNX27Q96L92 541 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 TCF25Q9BQ70 676 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 TCHPQ9BT92 498 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRRC27Q9C0I9 530 aa8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms