RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM65Q6PJ69 517 aa28.54■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 TFAP2BQ92481 460 aa28.54■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 SLITRK1Q96PX8 696 aa28.54■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 DUSP16Q9BY84 665 aa28.54■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 FOXQ1Q9C009 403 aa28.54■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 TDP1Q9NUW8 608 aa28.54■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 EHD2Q9NZN4 543 aa28.54■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 ZMYM5Q9UJ78 669 aa28.54■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa28.54■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 OBSL1O75147 1896 aa28.54■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 FAM92AA1XBS5 289 aa28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 KCNJ18B7U540 433 aa28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 CD19P15391 556 aa28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 CD72P21854 359 aa28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 AVPR2P30518 371 aa28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 ZXDBP98169 803 aa28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 GCNT1Q02742 428 aa28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 KCNJ12Q14500 433 aa28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 STX1AQ16623 288 aa28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 FAM114A1Q8IWE2 563 aa28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 YAF2Q8IY57 180 aa28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 DNASE1L2Q92874 299 aa28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 ZSWIM1Q9BR11 485 aa28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 RNF38Q9H0F5 515 aa28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 GREB1Q4ZG55 1949 aa28.53■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 SOBPA7XYQ1 873 aa28.52■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 OAS1P00973 400 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 HDCP19113 662 aa28.52■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 STARD6P59095 220 aa28.52■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 TPRG1Q6ZUI0 275 aa28.52■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 TTC16Q8NEE8 873 aa28.52■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 IRF7Q92985 503 aa28.52■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa28.52■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 ANO10Q9NW15 660 aa28.52■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 TSPAN16Q9UKR8 245 aa28.52■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 COL4A2P08572 1712 aa28.52■■■□□ 2.16
TPGS1-201ENST00000359315 TULP2O00295 520 aa28.51■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 CHADO15335 359 aa28.51■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 OLFM2O95897 454 aa28.51■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 USP17L7P0C7H9 530 aa28.51■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 TNK2Q07912 1038 aa28.51■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 USP4Q13107 963 aa28.51■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 VWA3BQ502W6 1294 aa28.51■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 GBP6Q6ZN66 633 aa28.51■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 TTC8Q8TAM2 541 aa28.51■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 SIX2Q9NPC8 291 aa28.51■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 O00370 1275 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 STK25O00506 426 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 CYP26A1O43174 497 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 AOC1P19801 751 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 BRD2P25440 801 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 PON1P27169 355 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 SOX9P48436 509 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF132P52740 706 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 TYRO3Q06418 890 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF77Q15935 545 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 SGO2Q562F6 1265 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 CDKAL1Q5VV42 579 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM68Q6AZZ1 485 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 SH3RF2Q8TEC5 729 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 DNAI2Q9GZS0 605 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 NDST4Q9H3R1 872 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 KIF9Q9HAQ2 790 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 PNPLA8Q9NP80 782 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 TAB2Q9NYJ8 693 aa28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 VDRP11473 427 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 PPP3CCP48454 512 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 CLCN5P51795 746 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 KIF11P52732 1056 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 PRKCQQ04759 706 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 EXOC3L4Q17RC7 722 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 TCP11X2Q5H9J9 407 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 PIGZQ86VD9 579 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD52Q8NB46 1076 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 PDZD8Q8NEN9 1154 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 UBA3Q8TBC4 463 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 OVCA2Q8WZ82 227 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 CCSER2Q9H7U1 834 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 NMUR1Q9HB89 426 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 TRPV5Q9NQA5 729 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 FANCLQ9NW38 375 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 COMMD8Q9NX08 183 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 OSER1Q9NX31 292 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 SMPD4Q9NXE4 827 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 GTSE1Q9NYZ3 720 aa28.49■■■□□ 2.15
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms