RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308941.9

PHYHD1-201, Transcript of phytanoyl-CoA dioxygenase domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PHYHD1, Length 1,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1-201ENST00000308941 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1-201ENST00000308941 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa18.09■□□□□ 0.49
PHYHD1-201ENST00000308941 KCNJ18B7U540 433 aa18.08■□□□□ 0.49
PHYHD1-201ENST00000308941 TULP2O00295 520 aa18.08■□□□□ 0.49
PHYHD1-201ENST00000308941 KCNJ12Q14500 433 aa18.08■□□□□ 0.49
PHYHD1-201ENST00000308941 TTC30AQ86WT1 665 aa18.08■□□□□ 0.49
PHYHD1-201ENST00000308941 MFSD6LQ8IWD5 586 aa18.08■□□□□ 0.49
PHYHD1-201ENST00000308941 FBXL6Q8N531 539 aa18.08■□□□□ 0.49
PHYHD1-201ENST00000308941 TFAP2BQ92481 460 aa18.08■□□□□ 0.49
PHYHD1-201ENST00000308941 FAXDC2Q96IV6 333 aa18.08■□□□□ 0.49
PHYHD1-201ENST00000308941 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
PHYHD1-201ENST00000308941 ARHGEF3Q9NR81 526 aa18.08■□□□□ 0.49
PHYHD1-201ENST00000308941 HEBP1Q9NRV9 189 aa18.08■□□□□ 0.49
PHYHD1-201ENST00000308941 GMIPQ9P107 970 aa18.08■□□□□ 0.49
PHYHD1-201ENST00000308941 DMDP11532 3685 aa18.08■□□□□ 0.49
PHYHD1-201ENST00000308941 ZNF840PA6NDX5 716 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 PI15O43692 258 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 CD19P15391 556 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 PSMC3P17980 439 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 YWHAQP27348 245 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 AVPR1AP37288 418 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 ZXDBP98169 803 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 TYRO3Q06418 890 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 CETN1Q12798 172 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 STX1AQ16623 288 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 TRIM65Q6PJ69 517 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 GAS2L3Q86XJ1 694 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 FBXO32Q969P5 355 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 RNF38Q9H0F5 515 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 MFSD1Q9H3U5 465 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 BRD9Q9H8M2 597 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 TAB2Q9NYJ8 693 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 WNT16Q9UBV4 365 aa18.08■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 MYO15AQ9UKN7 3530 aa18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 DPYSL4O14531 572 aa18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 COL9A1P20849 921 aa18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 TNK2Q07912 1038 aa18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 MAN2A1Q16706 1144 aa18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 SLC44A4Q53GD3 710 aa18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 TMEM105Q8N8V8 129 aa18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 UBA3Q8TBC4 463 aa18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 DUSP16Q9BY84 665 aa18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 FOXQ1Q9C009 403 aa18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 SIX2Q9NPC8 291 aa18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 ACP6Q9NPH0 428 aa18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 ANO10Q9NW15 660 aa18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 FANCLQ9NW38 375 aa18.07■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 SHISA7A6NL88 538 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 ARNTLO00327 626 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 CYP26A1O43174 497 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 CKMP06732 381 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 BRD2P25440 801 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 PON1P27169 355 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 SOX9P48436 509 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 VWA3BQ502W6 1294 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 TCP11X2Q5H9J9 407 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 CDKAL1Q5VV42 579 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 ARHGAP17Q68EM7 881 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 TRIM68Q6AZZ1 485 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 GBP6Q6ZN66 633 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 CEP295NLQ96MC4 621 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 TBC1D17Q9HA65 648 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 TDP1Q9NUW8 608 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 IL37Q9NZH6 218 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 TSPAN16Q9UKR8 245 aa18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 F5P12259 2224 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 STK25O00506 426 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 PES1O00541 588 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 ZNF263O14978 683 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 FCHO2Q0JRZ9 810 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 ARHGAP44Q17R89 818 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 EXOC3L4Q17RC7 722 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 FAM114A1Q8IWE2 563 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 YAF2Q8IY57 180 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 TTC39CQ8N584 583 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 BPIFB1Q8TDL5 484 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 NDST4Q9H3R1 872 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 CCSER2Q9H7U1 834 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 OSER1Q9NX31 292 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 SMPD4Q9NXE4 827 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 MUC6Q6W4X9 2439 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 MIA3Q5JRA6 1907 aa18.05■□□□□ 0.48
PHYHD1-201ENST00000308941 HDCP19113 662 aa18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms