RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295688.7

CCT3-201, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCT3, Length 2,150 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3-201ENST00000295688 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 KCNK13Q9HB14 408 aa15.48■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 ASNSD1Q9NWL6 643 aa15.48■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 TEX264Q9Y6I9 313 aa15.48■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 PHIPQ8WWQ0 1821 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 DPPA5A6NC42 116 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 I3L4J1 428 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 COPEO14579 308 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 KRT37O76014 449 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 CD19P15391 556 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 TNFSF9P41273 254 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 FAAP100Q0VG06 881 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 KCNT1Q5JUK3 1230 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 ATG16L1Q676U5 607 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 SH2D5Q6ZV89 423 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 SLC26A11Q86WA9 606 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 SPATA18Q8TC71 538 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 WNK4Q96J92 1243 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 FAM111AQ96PZ2 611 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 TEX13BQ9BXU2 312 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 KCNK4Q9NYG8 393 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 CNTN3Q9P232 1028 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 ZNF180Q9UJW8 692 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 LRCH1Q9Y2L9 728 aa15.47■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 FAM189A1O60320 539 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 PSMG1O95456 288 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 EDN1P05305 212 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 GSTA2P09210 222 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 SERPINB4P48594 390 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 FAM160B1Q5W0V3 765 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 RFWD3Q6PCD5 774 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 ZBTB33Q86T24 672 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 SLC4A11Q8NBS3 891 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 DNERQ8NFT8 737 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 SERAC1Q96JX3 654 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 C10orf88Q9H8K7 445 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 PAK5Q9P286 719 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 ZNF212Q9UDV6 495 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 KBTBD13C9JR72 458 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 MSCO60682 206 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 MAFO75444 373 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 PYGBP11216 843 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 BGNP21810 368 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 ASPAP45381 313 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 KCNJ11Q14654 390 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 NOMO1Q15155 1222 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 RCN1Q15293 331 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 SNX30Q5VWJ9 437 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 IER5Q5VY09 327 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 XYLT1Q86Y38 959 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 EXOC8Q8IYI6 725 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 SCYL3Q8IZE3 742 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 CCDC110Q8TBZ0 833 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 ZFAND2BQ8WV99 257 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 IFT43Q96FT9 208 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 C12orf42Q96LP6 360 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 C7orf26Q96N11 449 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 NMRK1Q9NWW6 199 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 TAS2R1Q9NYW7 299 aa15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CCT3-201ENST00000295688 F8W8V4 182 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 GAS2O43903 313 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 MAGEC1O60732 1142 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 RARBP10826 455 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 MYL2P10916 166 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 MIPP30301 263 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 RAP1GDS1P52306 607 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 SP2Q02086 613 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 TBCCQ15814 346 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 C6orf163Q5TEZ5 329 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 DCAF15Q66K64 600 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 DSTYKQ6XUX3 929 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 TMPRSS6Q8IU80 811 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 ZNF280CQ8ND82 737 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 FAF2Q96CS3 445 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 C2orf40Q9H1Z8 148 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 USP18Q9UMW8 372 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 NUMBLQ9Y6R0 609 aa15.45■□□□□ 0.06
CCT3-201ENST00000295688 SSC5DA1L4H1 1573 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms