RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 CLMNQ96JQ2 1002 aa18.96■□□□□ 0.63
PANX1-201ENST00000227638 B3GNT5Q9BYG0 378 aa18.96■□□□□ 0.63
PANX1-201ENST00000227638 CDT1Q9H211 546 aa18.96■□□□□ 0.63
PANX1-201ENST00000227638 VTNP04004 478 aa18.96■□□□□ 0.63
PANX1-201ENST00000227638 LMNB2Q03252 620 aa18.96■□□□□ 0.63
PANX1-201ENST00000227638 SETDB1Q15047 1291 aa18.96■□□□□ 0.63
PANX1-201ENST00000227638 PPIL6Q8IXY8 311 aa18.96■□□□□ 0.63
PANX1-201ENST00000227638 UNC5BQ8IZJ1 945 aa18.96■□□□□ 0.63
PANX1-201ENST00000227638 ZNF276Q8N554 614 aa18.96■□□□□ 0.63
PANX1-201ENST00000227638 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
PANX1-201ENST00000227638 ELP3Q9H9T3 547 aa18.96■□□□□ 0.63
PANX1-201ENST00000227638 USP18Q9UMW8 372 aa18.96■□□□□ 0.63
PANX1-201ENST00000227638 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 E2F8A0AVK6 867 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 CCDC189A1A4V9 331 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 H7C0C1 242 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 KITP10721 976 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 GRIA1P42261 906 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 ATP5OP48047 213 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 NBPF20Q3BBV1 942 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 MAGEC3Q8TD91 643 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 SEPT1Q8WYJ6 367 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 MIPEPQ99797 713 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 SLC13A1Q9BZW2 595 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 EBF2Q9HAK2 575 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 FAM49BQ9NUQ9 324 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 STARD13Q9Y3M8 1113 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 LAMA3Q16787 3333 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 IRF6O14896 467 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 CCNB1P14635 433 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 PEX19P40855 299 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 ARL4CP56559 192 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 DPYSL3Q14195 570 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 EFHC2Q5JST6 749 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 OR6B2Q6IFH4 312 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 RAB6BQ9NRW1 208 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 ARL8BQ9NVJ2 186 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 USH1CQ9Y6N9 552 aa18.95■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 SIGLEC16A6NMB1 481 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 CLGNO14967 610 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 ATP2A1O14983 1001 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 PHKA2P46019 1235 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 MCL1Q07820 350 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 TMEM62Q0P6H9 643 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 ZNF667Q5HYK9 610 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 CES4AQ5XG92 561 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 PPM1NQ8N819 430 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 MZB1Q8WU39 189 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 SPATA33Q96N06 139 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 HEY2Q9UBP5 337 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 SHOC2Q9UQ13 582 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 TNNC2P02585 160 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 CCDC110Q8TBZ0 833 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 ADPGKQ9BRR6 497 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 MIS12Q9H081 205 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 TMEM134Q9H6X4 195 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa18.94■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 PPEF2O14830 753 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 ALADP13716 330 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 SERPINB3P29508 390 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 PTK7Q13308 1070 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 DSTYKQ6XUX3 929 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 LBX2Q6XYB7 198 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 BBS12Q6ZW61 710 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 SCUBE3Q8IX30 993 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 FBXO27Q8NI29 283 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 RXFP2Q8WXD0 754 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 GPR20Q99678 358 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 CEP41Q9BYV8 373 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 ZFP69BQ9UJL9 534 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 ACTL7BQ9Y614 415 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 BPTFQ12830 3046 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 A0A087WZ62 844 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 KCNN4O15554 427 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 HMGCRP04035 888 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 CRADDP78560 199 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 RIPK1Q13546 671 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 ZPBP2Q6X784 338 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 ATP11CQ8NB49 1132 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 TTC25Q96NG3 672 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 LPXNO60711 386 aa18.93■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 LSM8O95777 96 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms