RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000052708.6

Ckap2l-201, Transcript of Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ckap2l, Length 3,137 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 CenphQ9QYM8 241 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Vwa8Q8CC88 1905 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Scn5aQ9JJV9 2019 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Zfp990B1AVN5 605 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 9330159F19RikD3Z623 648 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Gm2030D3Z7C4 212 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Olfr1354E9Q5G9 310 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Klc1O88447 541 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 PfkmP47857 780 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 CtswP56203 371 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Odr4Q4PJX1 447 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ccdc125Q5U465 500 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Scube3Q66PY1 993 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Mpp4Q6P7F1 635 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ccdc117Q6PB51 277 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Arhgap15Q811M1 481 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Znf689Q8BKK5 500 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Hook3Q8BUK6 718 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tph2Q8CGV2 488 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Colgalt1Q8K297 617 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Sh3d19Q91X43 789 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Cwh43Q91YL7 699 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Bbox1Q924Y0 387 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Dhx58Q99J87 678 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Fuca2Q99KR8 461 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Pard3bQ9CSB4 1203 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ddx47Q9CWX9 455 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Mms19Q9D071 1031 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Paip2Q9D6V8 124 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Slc40a1Q9JHI9 570 aa9.49□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Gm28919A0A087WP35 240 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Akap17bA2A3V1 959 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 P01652 108 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tcp1P11983 556 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ctnna1P26231 906 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ect2Q07139 913 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Aarsd1Q3THG9 412 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Stambpl1Q76N33 436 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Stk40Q7TNL3 435 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Olfr538Q7TRT5 310 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Slfn5Q8CBA2 884 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 ClasrpQ8CFC7 668 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Zmiz2Q8CIE2 920 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Glis1Q8K1M4 789 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Fam173bQ9D1Z3 247 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Nop56Q9D6Z1 580 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Scnn1bQ9WU38 638 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Cep85lA0A1W2P884 806 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Znf804aA2AKY4 1200 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Mocs3A2BDX3 460 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 CaluO35887 315 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Hoxd8P23463 289 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 AdkP55264 361 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Uchl4P58321 233 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tekt4Q149S1 447 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Fam193bQ3U2K0 892 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Cyp2j11Q3UNV2 504 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ift20Q61025 132 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ctnna2Q61301 953 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 KaznQ69ZS8 779 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Shkbp1Q6P7W2 704 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Npas4Q8BGD7 802 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Znf473Q8BI67 892 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Arhgef33Q8BW86 850 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ca12Q8CI85 354 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Dnm1lQ8K1M6 742 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tmem30aQ8VEK0 364 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Caskin2Q8VHK1 1201 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Q922C1 641 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Pdzd4Q9QY39 772 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Cpxm1Q9Z100 722 aa9.48□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 IqccA2ADZ8 418 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Olfr1305A2AVW3 312 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Daw1D3Z7A5 415 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 C6E9Q6D8 931 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Zfp275G3X904 499 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Gm3415J3QMS8 315 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Btg3P50615 252 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 B3gat3P58158 335 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Lman2lP59481 347 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 EfsQ64355 560 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Gabbr2Q80T41 940 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Cep104Q80V31 926 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Camta2Q80Y50 1208 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Nipal1Q8BMW7 416 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Zmym6Q8BS54 1249 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Clec1aQ8BWY2 269 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Tmem132cQ8CEF9 1099 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Nup58Q8R332 587 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Them5Q9CQJ0 248 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Ndufaf7Q9CWG8 436 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Q9D1Z2 194 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Gm3404Q9D506 307 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Homer2Q9QWW1 354 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Cdh23Q99PF4 3354 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Vmn2r19G5E8G4 854 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Pbx3O35317 434 aa9.47□□□□□ -0.89
Ckap2l-201ENSMUST00000052708 Fgfr1P16092 822 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.7 ms