RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ube4bQ9ES00 1173 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rabgap1lA6H6A9 815 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpina3iD3Z450 408 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klf6O08584 283 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cops5O35864 334 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ItgalP24063 1163 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 M6prP24668 278 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adamts10P58459 1104 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NfiaQ02780 532 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Samhd1Q60710 627 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr397Q8VEZ6 315 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DpysQ9EQF5 519 aa16.72■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf536Q8K083 1302 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm1141B9EJU1 475 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3371F7CQW8 167 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm20509G3UZF1 325 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nek2O35942 443 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gata5P97489 404 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnc2Q14B80 642 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc24a2Q14BI1 711 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 InscQ3HNM7 579 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spag6Q3V0U9 509 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Txndc8Q69AB2 127 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1505Q7TQQ2 316 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ascc2Q91WR3 749 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FtcdQ91XD4 541 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tekt1Q9DAJ2 418 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt7Q9DCV7 457 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf14Q9JI90 485 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atrnl1Q6A051 1378 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tubb1A2AQ07 451 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Per1O35973 1291 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HdcP23738 662 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pms2P54279 859 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q14AM7 275 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Glt6d1Q2NKH9 311 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atxn7l3bQ3UD01 97 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smcr8Q3UMB5 935 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfyve28Q6ZPK7 905 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rhpn2Q8BWR8 686 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dhx36Q8VHK9 1001 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gbp7Q91Z40 638 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ap2b1Q9DBG3 937 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rilpl1Q9JJC6 406 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dach1Q9QYB2 751 aa16.71■□□□□ 0.27
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PdgfraP26618 1089 aa16.71■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrkcbP68404 671 aa16.71■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arhgap45Q3TBD2 1116 aa16.71■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nt5c2Q3V1L4 560 aa16.71■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gramd1bQ80TI0 738 aa16.71■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dupd1Q8BK84 215 aa16.71■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Senp7Q8BUH8 1037 aa16.71■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tp53inp2Q8CFU8 221 aa16.71■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cog3Q8CI04 820 aa16.71■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lin7aQ8JZS0 233 aa16.71■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrp8Q924X6 996 aa16.71■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ggt7Q99JP7 662 aa16.71■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wars2Q9CYK1 360 aa16.71■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrccQ9EQC8 491 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sned1Q70E20 1403 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mageb4A2A9R3 556 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dpy19l4A2AJQ3 722 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PdgfaP20033 211 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sash1P59808 1230 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mark2Q05512 776 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adrbk2Q3UYH7 688 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PterQ60866 349 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf598Q80YR4 908 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pgm5Q8BZF8 567 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dhx32Q8BZS9 744 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 YarsQ91WQ3 528 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mmp10O55123 476 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Grpel2O88396 224 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Epn3Q91W69 636 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DaglbQ91WC9 669 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp623Q9CY99 499 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc12a4Q9JIS8 1085 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp6v0a1Q9Z1G4 839 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdpk1Q9Z2A0 559 aa16.7■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm29554A0A087WNW4 188 aa16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8909G3UXE9 396 aa16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hoxc13P50207 328 aa16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clcn3P51791 818 aa16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Taf1bP97358 586 aa16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abi3bpQ59IW6 1179 aa16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hbs1lQ69ZS7 682 aa16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bnip1Q6QD59 228 aa16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gga1Q8R0H9 635 aa16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stx18Q8VDS8 334 aa16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dock2Q8C3J5 1828 aa16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr456B2RT27 312 aa16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc8D3YZV8 685 aa16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdh9F8VPK8 1237 aa16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpsm3Q3U1Z5 159 aa16.69■□□□□ 0.26
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clptm1Q8VBZ3 664 aa16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 59.9 ms