RNA–Protein interactions for RNA: YOR069W

VPS5, Transcript of Nexin-1 homolog, yeast

Gene VPS5, Length 2,028 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VPS5	YOR069W	MIC12	P38341	106 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VPS5	YOR069W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
VPS5	YOR069W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VPS5	YOR069W	VMA11	P32842	164 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VPS5	YOR069W	NRM1	P53718	249 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VPS5	YOR069W	YNL190W	P53872	204 aa		4.67	□□□□□ -1.66
VPS5	YOR069W	YLR415C	O13578	112 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VPS5	YOR069W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
VPS5	YOR069W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
VPS5	YOR069W	YIL059C	P40520	121 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VPS5	YOR069W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.66	□□□□□ -1.66
VPS5	YOR069W	CCW14	O13547	238 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VPS5	YOR069W	RPB10	P22139	70 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VPS5	YOR069W	LCB3	P47013	409 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VPS5	YOR069W	KNH1	P50112	268 aa		4.65	□□□□□ -1.66
VPS5	YOR069W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	LDB16	P25587	256 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	MRPS12	P53732	153 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	INO2	P26798	304 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	YHL042W	P38729	150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	AIM19	P40502	157 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	DCV1	P43595	202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	SMP1	P38128	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
VPS5	YOR069W	YGR025W	P53216	100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	YDR029W	Q12111	104 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	POR2	P40478	281 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	YGR045C	P53229	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	YGR219W	P53307	113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	SED1	Q01589	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	ECM12	O13529	151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	PEX17	P40155	199 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	CAX4	P53223	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	PBA1	Q05778	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	YJR146W	P47174	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	NCE103	P53615	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	YNL046W	P53956	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	TRP1	P00912	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	YER121W	P40076	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	KEG1	P43614	200 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	BNA1	P47096	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	IES6	P32617	166 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	HUR1	P45820	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VPS5	YOR069W	IRA2	P19158	3079 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	HFA1	P32874	2273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	STF1	P01098	86 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	SHU1	P38751	150 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	YHR022C	P38763	256 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	UBC5	P15732	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	TOM6	P33448	61 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	EMC6	Q12431	108 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	YHL037C	P38733	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	MPC2	P38857	129 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	SBH2	P52871	88 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	SHH4	Q06236	168 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	MSA2	P36157	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	YBR209W	P38311	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	YGL088W	P53151	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	QCR8	P08525	94 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	SIM1	P40472	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	CCW12	Q12127	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	SVP26	P38869	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	RRT13	P40042	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	YSY6	P38374	65 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	KRE9	P39005	276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	YEL008W	P40001	126 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	BPH1	P25356	2167 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	YCR050C	P25630	102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	RGM1	Q00453	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VPS5	YOR069W	PPT2	Q12036	173 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VPS5	YOR069W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		4.52	□□□□□ -1.69
VPS5	YOR069W	YNL194C	P40169	301 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VPS5	YOR069W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
VPS5	YOR069W	SBH1	P52870	82 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VPS5	YOR069W	YML122C	Q03207	126 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VPS5	YOR069W	YER135C	P40082	130 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VPS5	YOR069W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VPS5	YOR069W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VPS5	YOR069W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.51	□□□□□ -1.69
VPS5	YOR069W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.49	□□□□□ -1.69
VPS5	YOR069W	YER187W	P40102	141 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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