RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W YMR295CQ03559 197 aa5.64□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W TRP1P00912 224 aa5.63□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W YGL041C-BQ3E750 60 aa5.63□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W YNR034W-AQ3E841 98 aa5.63□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W POM33Q12164 279 aa5.62□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W VMA9Q3E7B6 73 aa5.61□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W YAL065CO13511 128 aa5.6□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W YLR156WP0CE96 114 aa5.6□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W YLR159WP0CE97 114 aa5.6□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W YLR161WP0CE98 114 aa5.6□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W DAN1P47178 298 aa5.6□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W YAR029WP39549 74 aa5.59□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W Q0142Q9ZZW4 58 aa5.59□□□□□ -1.51
YLR349WYLR349W YLR415CO13578 112 aa5.58□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W CDC43P18898 376 aa5.58□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W PFY1P07274 126 aa5.56□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W AQY2P0CD90 149 aa5.56□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W PAU19P0CE85 124 aa5.56□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W PAU21P0CE86 164 aa5.56□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W PAU22P0CE87 164 aa5.56□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W PRE1P22141 198 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W PAU3P25610 124 aa5.56□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W LAC1P28496 418 aa5.56□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W APS1P35181 156 aa5.56□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W DAD2P36162 133 aa5.56□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W PAU15P40585 124 aa5.56□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W YPR014CQ6B0W2 109 aa5.56□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W Q0032Q9ZZX7 96 aa5.56□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W AQY1P0CD91 305 aa5.55□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W WIP1Q2V2P8 89 aa5.55□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa5.55□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W ARO2P28777 376 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W RPF1P38805 295 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W APS2Q00381 147 aa5.54□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W MGR2Q02889 113 aa5.54□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W POR1P04840 283 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W UBC4P15731 148 aa5.53□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W YOR268CQ08734 132 aa5.53□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W ATP14Q12349 124 aa5.53□□□□□ -1.52
YLR349WYLR349W ADH3P07246 375 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W LDS1P31379 325 aa5.52□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W NTF2P33331 125 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W HSP10P38910 106 aa5.52□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W FMP16Q12497 93 aa5.52□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W CMC4Q3E7A9 73 aa5.52□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W URM1P40554 99 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W YIL014C-AQ02598 104 aa5.51□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W YDL241WQ07738 123 aa5.51□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W SEC4P07560 215 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W UBC12P52491 188 aa5.5□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W PCL2P25693 308 aa5.49□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W OXA1P39952 402 aa5.49□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W IGD1P43598 195 aa5.49□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W TOS6P48560 102 aa5.49□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W YFL019CP43576 117 aa5.48□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W YGL193CP53097 103 aa5.48□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W KTI11Q3E840 82 aa5.48□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W STF1P01098 86 aa5.47□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W HMRA2P0CY13 119 aa5.47□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W NHP6AP11632 93 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W YOP1Q12402 180 aa5.47□□□□□ -1.53
YLR349WYLR349W PAU16P35994 123 aa5.46□□□□□ -1.54
YLR349WYLR349W YDR042CQ03205 200 aa5.46□□□□□ -1.54
YLR349WYLR349W YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa5.46□□□□□ -1.54
YLR349WYLR349W ATP15P21306 62 aa5.45□□□□□ -1.54
YLR349WYLR349W SRB6P32570 121 aa5.44□□□□□ -1.54
YLR349WYLR349W COX14P39103 70 aa5.44□□□□□ -1.54
YLR349WYLR349W KNH1P50112 268 aa5.44□□□□□ -1.54
YLR349WYLR349W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
YLR349WYLR349W MVB12P42939 101 aa5.43□□□□□ -1.54
YLR349WYLR349W CMC2Q3E7A4 109 aa5.42□□□□□ -1.54
YLR349WYLR349W COA3Q3E7B2 85 aa5.42□□□□□ -1.54
YLR349WYLR349W YBL039W-BP0C268 59 aa5.41□□□□□ -1.54
YLR349WYLR349W CNB1P25296 175 aa5.41□□□□□ -1.54
YLR349WYLR349W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
YLR349WYLR349W ABF2Q02486 183 aa5.41□□□□□ -1.54
YLR349WYLR349W TOA2P32774 122 aa5.4□□□□□ -1.54
YLR349WYLR349W SCM4P32564 187 aa5.38□□□□□ -1.55
YLR349WYLR349W RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
YLR349WYLR349W VMA21P41806 77 aa5.37□□□□□ -1.55
YLR349WYLR349W ERV14P53173 138 aa5.37□□□□□ -1.55
YLR349WYLR349W SHU1P38751 150 aa5.36□□□□□ -1.55
YLR349WYLR349W CPR1P14832 162 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YLR349WYLR349W PPT2Q12036 173 aa5.35□□□□□ -1.55
YLR349WYLR349W YLR112WQ12130 139 aa5.34□□□□□ -1.55
YLR349WYLR349W ATP16Q12165 160 aa5.34□□□□□ -1.55
YLR349WYLR349W KSH1Q8TGJ3 72 aa5.34□□□□□ -1.55
YLR349WYLR349W HOT13P36078 116 aa5.33□□□□□ -1.56
YLR349WYLR349W KRE1P17260 313 aa5.32□□□□□ -1.56
YLR349WYLR349W YJR085CP47131 105 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YLR349WYLR349W SPG1P50088 95 aa5.31□□□□□ -1.56
YLR349WYLR349W ADH1P00330 348 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.1 ms