RNA–Protein interactions for RNA: YJR040W

GEF1, Transcript of Voltage-gated chloride channel, yeast

Gene GEF1, Length 2,340 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GEF1	YJR040W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GEF1	YJR040W	ECM12	O13529	151 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	MLF3	P32047	452 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	YHR140W	P38842	239 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	VHS2	P40463	436 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	MST27	P53176	234 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	AQY1	P0CD91	305 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	YKL070W	P36087	169 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	ABF2	Q02486	183 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	YHR213W	P0CI67	198 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	RRT1	P38192	103 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	ERG28	P40030	148 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	IRC23	Q08416	157 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	YHR139C-A	O13536	103 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	HMRA2	P0CY13	119 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	CAX4	P53223	239 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	ATP23	P53722	227 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	YNL234W	P53857	426 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	MGR2	Q02889	113 aa		5	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	TIM22	Q12328	207 aa		5	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	Q0255	P03881	472 aa		5	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		5	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	UBC11	P52492	156 aa		5	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	COX12	Q01519	83 aa		5	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		5	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	YNL217W	P40152	326 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	YGR045C	P53229	120 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	YIA6	P40556	373 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	IMP2	P46972	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	YHL042W	P38729	150 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	GLE2	P40066	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	INO2	P26798	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	SMP1	P38128	452 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	GPI19	Q04082	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	AGA1	P32323	725 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	AIM34	Q03673	198 aa		4.96	□□□□□ -1.61
GEF1	YJR040W	PFY1	P07274	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	SBH1	P52870	82 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	YCL042W	P25572	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	PRM7	Q12459	698 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	AIM11	P87275	137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	RPB9	P27999	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	TOM6	P33448	61 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	ALG13	P53178	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	YCR050C	P25630	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	TOS6	P48560	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	BPH1	P25356	2167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	YGL015C	P33199	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	YGR025W	P53216	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	YNL190W	P53872	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	SPI1	P40092	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	AIM19	P40502	157 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	PBA1	Q05778	276 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GEF1	YJR040W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GEF1	YJR040W	ATP15	P21306	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GEF1	YJR040W	GLO1	P50107	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GEF1	YJR040W	RRT13	P40042	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GEF1	YJR040W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GEF1	YJR040W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GEF1	YJR040W	POR2	P40478	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GEF1	YJR040W	SRL1	Q08673	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GEF1	YJR040W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GEF1	YJR040W	SVP26	P38869	228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GEF1	YJR040W	SIM1	P40472	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GEF1	YJR040W	SHH4	Q06236	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GEF1	YJR040W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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