RNA–Protein interactions for RNA: YJL177W

RPL17B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L17B, yeastyeast

Gene RPL17B, Length 555 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL17BYJL177W VMA21P41806 77 aa2.06□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W HUR1P45820 110 aa2.06□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W CIS3P47001 227 aa2.06□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YJL144WP47009 104 aa2.06□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W POP3P53833 195 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YDR042CQ03205 200 aa2.06□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W MRPS8Q03799 155 aa2.06□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W TVP15Q03860 143 aa2.06□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W AVO2Q04749 426 aa2.06□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YLR296WQ05898 108 aa2.06□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W EMC6Q12431 108 aa2.06□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YMR030W-AQ3E760 96 aa2.06□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YMR175W-AQ3E766 64 aa2.06□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W CYR1P08678 2026 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W VPS13Q07878 3144 aa2.06□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W ATP15P21306 62 aa2.05□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YKL044WP36092 106 aa2.05□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YKR045CP36138 183 aa2.05□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YJL028WP47062 111 aa2.05□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W ATP19P81451 68 aa2.05□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W MET31Q03081 177 aa2.05□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W LIP1Q03579 150 aa2.05□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YHP1Q04116 353 aa2.05□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W RIM9Q04734 239 aa2.05□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W FYV12Q08559 129 aa2.05□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W DAD1Q12248 94 aa2.05□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W TIM22Q12328 207 aa2.05□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W ATO3Q12359 275 aa2.05□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W ODC2Q99297 307 aa2.05□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W PAU21P0CE86 164 aa2.04□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W PAU22P0CE87 164 aa2.04□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W RPB7P34087 171 aa2.04□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W ECO1P43605 281 aa2.04□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YPL247CQ12523 523 aa2.04□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W SCS22Q6Q595 175 aa2.04□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W BEM2P39960 2167 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YHR213WP0CI67 198 aa2.03□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W FYV5P25585 152 aa2.03□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W MRP17P28778 131 aa2.03□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YBR292CP38357 123 aa2.03□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YHL042WP38729 150 aa2.03□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data2.03□□□□□ -2.08not detected
RPL17BYJL177W PAU15P40585 124 aa2.03□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YMR295CQ03559 197 aa2.03□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YOR015WQ12169 119 aa2.03□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YIL102C-AQ2V2P5 75 aa2.03□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YAL063C-AQ3E791 96 aa2.03□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W RRT15Q3E811 62 aa2.03□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W YFL041W-AQ3E817 63 aa2.03□□□□□ -2.08
RPL17BYJL177W TIM9O74700 87 aa2.02□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W QCR10P37299 77 aa2.02□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YBR032WP38223 100 aa2.02□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W UMP1P38293 148 aa2.02□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YHL005CP38752 130 aa2.02□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W RSM18P40033 138 aa2.02□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YNL217WP40152 326 aa2.02□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W MIC27P50945 234 aa2.02□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W IGO1P53897 168 aa2.02□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YDR274CP87283 123 aa2.02□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W GRX5Q02784 150 aa2.02□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YDL157CQ12082 118 aa2.02□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W ATP20Q12233 115 aa2.02□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W STT4P37297 1900 aa2.01□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W PAU19P0CE85 124 aa2.01□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W PAU3P25610 124 aa2.01□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W FZF1P32805 299 aa2.01□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YER187WP40102 141 aa2.01□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YIL086CP40503 102 aa2.01□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W COX12Q01519 83 aa2.01□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YML079WQ03629 201 aa2.01□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YDR114CQ04597 100 aa2.01□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W SOM1Q05676 74 aa2.01□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa2.01□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YPL038W-AQ3E7B4 63 aa2.01□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W NHP2P32495 156 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W PAU16P35994 123 aa2□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W RRT1P38192 103 aa2□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W CTR2P38865 189 aa2□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W ICY1Q04329 127 aa2□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W ATG41Q12048 136 aa2□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa2□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W PAU2P32612 120 aa1.99□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W MPC3P53311 146 aa1.99□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YOR105WQ08504 108 aa1.99□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YPL261CQ08976 102 aa1.99□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W MHF2Q3E829 80 aa1.99□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa1.99□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W RPS27AP35997 82 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W RPS27BP38711 82 aa1.98□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W ICS3P47034 131 aa1.98□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W PAU12P53343 120 aa1.98□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YKR032WP36127 104 aa1.97□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W PDX3P38075 228 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W YHR125WP38831 101 aa1.97□□□□□ -2.09
RPL17BYJL177W HSP10P38910 106 aa1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.5 ms