RNA–Protein interactions for RNA: YHR114W

BZZ1, Transcript of SH3 domain protein implicated in regulating actin polymerization, yeast

Gene BZZ1, Length 1,902 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BZZ1	YHR114W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	ISF1	P32488	338 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	MPC2	P38857	129 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	DAD4	P69851	72 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	TAO3	P40468	2376 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.67	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	ATP23	P53722	227 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	YNL234W	P53857	426 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	YNL046W	P53956	172 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	MGR2	Q02889	113 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	PPT2	Q12036	173 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	KEG1	P43614	200 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	NCE101	Q02820	53 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	IRC19	Q07843	230 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BZZ1	YHR114W	GAT4	P40569	121 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	MED6	P38782	295 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	MTC6	P38849	526 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YMR141C	P40211	102 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	PIR5	P46999	287 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	LDB16	P25587	256 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	CTR2	P38865	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	ECO1	P43605	281 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YML122C	Q03207	126 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	ICY1	Q04329	127 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YOR268C	Q08734	132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	DIF1	O13577	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	PEX17	P40155	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	AGA1	P32323	725 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YHR022C	P38763	256 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	DCV1	P43595	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	ICS3	P47034	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	FHN1	P53279	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	SPS100	P13130	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YNL190W	P53872	204 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	TEL1	P38110	2787 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	TOS6	P48560	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	GLO1	P50107	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	PRM7	Q12459	698 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	RSM18	P40033	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	HUR1	P45820	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	ATP20	Q12233	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BZZ1	YHR114W	FAB1	P34756	2278 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	SPI1	P40092	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	ATP15	P21306	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	TDA2	P40045	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	YIL029C	P40538	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	PGU1	P47180	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	YBR144C	P34215	104 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	MSA2	P36157	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	YDR274C	P87283	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	VPS68	Q12016	184 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	YGL034C	P53186	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
BZZ1	YHR114W	YCR022C	P25620	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	YKR045C	P36138	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	YBL071C	P38185	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	IMP2	P46972	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	YGR018C	P53211	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	PCP1	P53259	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	TRS23	Q03784	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BZZ1	YHR114W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 60.1 ms