RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	VHS2	P40463	436 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	YFR035C	P43608	114 aa		6.23	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	YJR146W	P47174	117 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	RTG1	P32607	177 aa		6.21	□□□□□ -1.41
GGA2	YHR108W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YKR041W	P36134	250 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	AIM11	P87275	137 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		6.21	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	TRP1	P00912	224 aa		6.2	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	IGO2	Q9P305	131 aa		6.2	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	ATP15	P21306	62 aa		6.19	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	MSN1	P22148	382 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	AIM29	P36154	155 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YBR209W	P38311	105 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	PMP3	P87284	55 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	PAI3	P01094	68 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	ANB1	P19211	157 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YLR296W	Q05898	108 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	OXA1	P39952	402 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YEL067C	P39978	195 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YER181C	P40097	107 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YNL217W	P40152	326 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YNR077C	P53758	84 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YDR274C	P87283	123 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YLR194C	Q05777	254 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	MSA1	Q08471	629 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		6.17	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YNL198C	P40166	100 aa		6.16	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YPS5	P53057	165 aa		6.16	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	YGL088W	P53151	121 aa		6.16	□□□□□ -1.42
GGA2	YHR108W	CYC7	P00045	113 aa		6.15	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	PEX17	P40155	199 aa		6.15	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	YIL059C	P40520	121 aa		6.15	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		6.15	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	CIN5	P40917	295 aa		6.14	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	YFR057W	P43625	151 aa		6.14	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	UBC5	P15732	148 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	YEL008W	P40001	126 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	AGE2	P40529	298 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	6.13	□□□□□ -1.43	not detected
GGA2	YHR108W	SHU1	P38751	150 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	KRE9	P39005	276 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	YER085C	P40058	173 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	COX12	Q01519	83 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	ISU2	Q12056	156 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	MLF3	P32047	452 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	6.11	□□□□□ -1.43	not detected
GGA2	YHR108W	SCW10	Q04951	389 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	YPT53	P36019	220 aa		6.1	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	POP7	P38291	140 aa		6.1	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	YCR001W	P25347	104 aa		6.09	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	MRPS12	P53732	153 aa		6.09	□□□□□ -1.43
GGA2	YHR108W	UGX2	P32772	223 aa		6.08	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	QCR8	P08525	94 aa		6.08	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	YAR029W	P39549	74 aa		6.08	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	MET32	Q12041	191 aa		6.07	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		6.06	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	PPT2	Q12036	173 aa		6.06	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	YNL190W	P53872	204 aa		6.05	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	MID2	P36027	376 aa		6.04	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	YMR295C	Q03559	197 aa		6.04	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	VAM10	Q08474	114 aa		6.04	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	CRC1	Q12289	327 aa		6.03	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	CDC43	P18898	376 aa		6.03	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	SGF11	Q03067	99 aa		6.03	□□□□□ -1.44
GGA2	YHR108W	NRG2	P38082	220 aa		6.02	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	RUB1	Q03919	77 aa		6.02	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	NUM1	Q00402	2748 aa		6.02	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	SAP30	P38429	201 aa		6.01	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	YLR281C	Q05863	155 aa		6.01	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	YBR219C	P38317	127 aa		6.01	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	YHR130C	P38834	111 aa		6.01	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	COX14	P39103	70 aa		6.01	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	ENV10	Q99382	181 aa		6.01	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	DUT1	P33317	147 aa		6	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	TOA2	P32774	122 aa		5.99	□□□□□ -1.45
GGA2	YHR108W	YPL257W	Q08974	193 aa		5.99	□□□□□ -1.45

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