RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 TIE1P35590 1138 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEFF1Q8IYR6 380 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 WHAMMQ8TF30 809 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 SEL1LQ9UBV2 794 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 OBSL1O75147 1896 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-217ENST00000629983 DENND4CQ5VZ89 1909 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R37O75864 691 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ABL1P00519 1130 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 BDNFP23560 247 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP27A1Q02318 531 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO1EQ12965 1108 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SOWAHAQ2M3V2 549 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM92Q6UXU6 159 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PGBD3Q8N328 593 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE11AQ9HCR9 933 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SMPD4Q9NXE4 827 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 IGF2RP11717 2491 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 GABRDO14764 452 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 APODP05090 189 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 GAP43P17677 238 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 HMGB4Q8WW32 186 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 GATA6Q92908 595 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA17Q96L03 361 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PNKPQ96T60 521 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PCIF1Q9H4Z3 704 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SIX4Q9UIU6 781 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CDH9Q9ULB4 789 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CPQQ9Y646 472 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 GARTP22102 1010 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 P2RY2P41231 377 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC6A11P48066 632 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ZXDBP98169 803 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 KDSRQ06136 332 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 RESTQ13127 1097 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 DHCR24Q15392 516 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 GAB4Q2WGN9 574 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM171BQ6P995 826 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 VSTM1Q6UX27 236 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 OLIG1Q8TAK6 271 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC39Q9UFE4 941 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SGK1O00141 431 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFRSF10BO14763 440 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CFIP05156 583 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PDGFRBP09619 1106 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 IDEP14735 1019 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ENGP17813 658 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PFKLP17858 780 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PTGER3P43115 390 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 USP46P62068 366 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 EOGTQ5NDL2 527 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 LYSMD4Q5XG99 296 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SYT12Q8IV01 421 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SFTPA1Q8IWL2 248 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 IL17RCQ8NAC3 791 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CXorf38Q8TB03 319 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 EPSTI1Q96J88 318 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 TMX3Q96JJ7 454 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CBWD1Q9BRT8 395 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 STRA6Q9BX79 667 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 EHD2Q9NZN4 543 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 STK17AQ9UEE5 414 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SMC3Q9UQE7 1217 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ATRXP46100 2492 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 LAMA1P25391 3075 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCA7Q8IZY2 2146 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 KAT7O95251 611 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 LMO2P25791 158 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 FRMD1Q8N878 549 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 HPDLQ96IR7 371 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 FNBP1Q96RU3 617 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CRTAC1Q9NQ79 661 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF4Q9NR80 690 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP97Q9P2B7 532 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM66O15016 1216 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ADH1CP00326 375 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-217ENST00000629983 TNNC2P02585 160 aa29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms