RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 NAGPAQ9UK23 515 aa9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 ATG2BQ96BY7 2078 aa9.52□□□□□ -0.88
TTR-204ENST00000610404 MTMR11A4FU01 709 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 M0QZQ0 153 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 HIP1RO75146 1068 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 OAZ2O95190 189 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 GABRR2P28476 465 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 MPLP40238 635 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 EPHB3P54753 998 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 CYP4F8P98187 520 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 GUCY1B3Q02153 619 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 ST3GAL1Q11201 340 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 ZNF174Q15697 407 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 GPR158Q5T848 1215 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 CENPPQ6IPU0 288 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 FSTL4Q6MZW2 842 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 ATAD1Q8NBU5 361 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 GTF3C6Q969F1 213 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 CHFRQ96EP1 664 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 LOXL4Q96JB6 756 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 TMEM209Q96SK2 561 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 TCHPQ9BT92 498 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 EML5Q05BV3 1969 aa9.52□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 E9PMD0 336 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 PPEF2O14830 753 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 GIPC1O14908 333 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 SLC16A4O15374 487 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 MAP3K6O95382 1288 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 CCDC192P0DO97 292 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 CXCL8P10145 99 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 MUTP22033 750 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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TTR-204ENST00000610404 ALDH1A3P47895 512 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 GUCY2FP51841 1108 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 CDR1P51861 262 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 GPR17Q13304 367 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 PLD1Q13393 1074 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 HAUS3Q68CZ6 603 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 HAUS6Q7Z4H7 955 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 DTWD1Q8N5C7 304 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 PSMG2Q969U7 264 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 TP53INP1Q96A56 240 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 HPS4Q9NQG7 708 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 KMT5AQ9NQR1 393 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 OBP2AQ9NY56 170 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.51□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 OR6C75A6NL08 312 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 TOM1L1O75674 476 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 SPINK2P20155 84 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 TNFSF9P41273 254 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 MCM2P49736 904 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 TRIM29Q14134 588 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.891e-6■□□□□ 11
TTR-204ENST00000610404 ZBTB6Q15916 424 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 PLK5Q496M5 336 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 TMEM196Q5HYL7 178 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 RNF43Q68DV7 783 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 TRIM68Q6AZZ1 485 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 OVOS1Q6IE37 1185 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 KCNK18Q7Z418 384 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 FAM35AQ86V20 835 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 C4orf32Q8N8J7 132 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 RIN3Q8TB24 985 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 HHIPQ96QV1 700 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 TASP1Q9H6P5 420 aa9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TTR-204ENST00000610404 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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