RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A087X0B3 334 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 LNP1A1A4G5 178 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 K7EQS6 105 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 TNNC2P02585 160 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 ATXN8OSP0DMR3 200 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 BDNFP23560 247 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 GBP1P32455 592 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 GRIK1P39086 918 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 STAT6P42226 847 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 USP46P62068 366 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 RESTQ13127 1097 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 CUL4AQ13619 759 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 SURF1Q15526 300 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 PMS2CLQ68D20 193 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM173BQ6P4H8 233 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 C11orf74Q86VG3 221 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA1958Q8N8K9 716 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 PCED1BQ96HM7 432 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 HPDLQ96IR7 371 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 TTLL2Q9BWV7 592 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 TPSD1Q9BZJ3 242 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 MMP17Q9ULZ9 603 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 INVSQ9Y283 1065 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 ASPMQ8IZT6 3477 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF840PA6NDX5 716 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 ANTXRLA6NF34 631 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF233A6NK53 670 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 C4orf47A7E2U8 309 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 LEFTY2O00292 366 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM66O15016 1216 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 OLFM2O95897 454 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP17A1P05093 508 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 PDCP20941 246 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 BCKDHBP21953 392 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 WARSP23381 471 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 ANXA13P27216 316 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 SEC13P55735 322 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 NOP14P78316 857 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC7A9P82251 487 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP27A1Q02318 531 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 DUOXA2Q1HG44 320 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 C2orf27AQ580R0 203 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 ANO7Q6IWH7 933 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 CBWD2Q8IUF1 395 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR49Q8IV35 697 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC65Q8IXS2 484 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 MDGA1Q8NFP4 955 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 MMS19Q96T76 1030 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 PANK2Q9BZ23 570 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 EHD2Q9NZN4 543 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 MYOFQ9NZM1 2061 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 F8VP50 259 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 OAS1P00973 400 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 PDGFRBP09619 1106 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP3CCP48454 512 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 CRY1Q16526 586 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP2U1Q7Z449 544 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC33Q8N5R6 958 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 GLIS3Q8NEA6 775 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 C8orf48Q96LL4 319 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 USP28Q96RU2 1077 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF38Q9H0F5 515 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA1586Q9HCI6 787 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 HSPBP1Q9NZL4 362 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 NME7Q9Y5B8 376 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 CPQQ9Y646 472 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 PATE3B3GLJ2 98 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 GIPC1O14908 333 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 TACC1O75410 805 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 SYT1P21579 422 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 HOXD13P35453 343 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms