RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM51Q9NW97 253 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 CYTH4Q9UIA0 394 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.8■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 AP1G2O75843 785 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 FGGP02679 453 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 GLI1P08151 1106 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 BRCC3P46736 316 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL34P49207 117 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 RGS7P49802 495 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PEX5P50542 639 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPROQ16827 1216 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP9Q49MG5 647 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 FUKQ8N0W3 1084 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 EXD1Q8NHP7 514 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PNPLA8Q9NP80 782 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 STK39Q9UEW8 545 aa23.79■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 OR6C75A6NL08 312 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 DDHD2O94830 711 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 SDC4P31431 198 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PCK1P35558 622 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PMF1Q6P1K2 205 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC26A9Q7LBE3 791 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM35AQ86V20 835 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF280BQ86YH2 543 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 MS4A14Q96JA4 679 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PAAF1Q9BRP4 392 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT82Q9NSB4 513 aa23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 V9GYY5 206 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 DPYSL4O14531 572 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 OAZ2O95190 189 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PDGFRAP16234 1089 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 C2orf54Q08AI8 447 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 BRD3Q15059 726 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF280DQ6N043 979 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 MFSD5Q6N075 450 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC50Q8IVM0 306 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 B3GNT5Q9BYG0 378 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CAPNS1-212ENST00000591041 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 NRP1O14786 923 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 HSF2BPO75031 334 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM171BQ6P995 826 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 HASPINQ8TF76 798 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 CNGB3Q9NQW8 809 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 RRN3Q9NYV6 651 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 NME7Q9Y5B8 376 aa23.76■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 LCP1P13796 627 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.75■■□□□ 1.392e-7■□□□□ 8.5
CAPNS1-212ENST00000591041 OLFML1Q6UWY5 402 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 PIGZQ86VD9 579 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP7D3Q8IWC1 876 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 IRGQQ8WZA9 623 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 ALG3Q92685 438 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT35Q92764 455 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 PCED1BQ96HM7 432 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 CRTAC1Q9NQ79 661 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 CACNG4Q9UBN1 327 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 RASAL2Q9UJF2 1139 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 STAP1Q9ULZ2 295 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP2C2O75185 946 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT1P04264 644 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 RHOXF2BP0C7M4 288 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 CHRNA3P32297 505 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 LLGL2Q6P1M3 1020 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKS3Q6ZW76 656 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 RXFP2Q8WXD0 754 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD7Q92527 254 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 MYLPFQ96A32 169 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 RHOXF2Q9BQY4 288 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 HTATIP2Q9BUP3 242 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM59LQ9UK28 342 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC3P53804 2025 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 MYBPHLA2RUH7 354 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 C2CD4BA6NLJ0 364 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 I3L4J1 428 aa23.73■■□□□ 1.39
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