RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 CXCL12P48061 93 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 CACNA2D1P54289 1103 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 CDH8P55286 799 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 USP4Q13107 963 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 NCOA4Q13772 614 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 CCINQ13939 588 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 MTF1Q14872 753 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF77Q15935 545 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 KIAA2013Q8IYS2 634 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 CHFRQ96EP1 664 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 GCNT4Q9P109 453 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 EML5Q05BV3 1969 aa24.21■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 SPAG17Q6Q759 2223 aa24.2■■□□□ 1.47
PPP4C-212ENST00000567828 CLDN5O00501 218 aa24.2■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 AP3M2P53677 418 aa24.2■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 DPYDQ12882 1025 aa24.2■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 KCNB1Q14721 858 aa24.2■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF667Q5HYK9 610 aa24.2■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 CEP135Q66GS9 1140 aa24.2■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM174Q8WUU8 243 aa24.2■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 CEP295NLQ96MC4 621 aa24.2■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 TTLL2Q9BWV7 592 aa24.2■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 B3GNT5Q9BYG0 378 aa24.2■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 EPC1Q9H2F5 836 aa24.2■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 VRTNQ9H8Y1 702 aa24.2■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 C2orf42Q9NWW7 574 aa24.2■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 A0A1W2PQ27 194 aa24.19■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 A0A1W2PQ64 194 aa24.19■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 A0A1W2PQD8 194 aa24.19■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 RHOBTB3O94955 611 aa24.19■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 NRLP54845 237 aa24.19■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 KRBA2Q6ZNG9 492 aa24.19■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 C8orf48Q96LL4 319 aa24.19■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 ELOVL4Q9GZR5 314 aa24.19■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 SDCBP2Q9H190 292 aa24.19■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa24.19■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 WNT6Q9Y6F9 365 aa24.19■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 CALUO43852 315 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 NOP14P78316 857 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 DMWDQ09019 674 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 PDGFRLQ15198 375 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 SH3RF2Q8TEC5 729 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 NCDNQ9UBB6 729 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa24.18■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 HDCP19113 662 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 ZACNQ401N2 412 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM196Q5HYL7 178 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 C1orf220Q5T0J3 134 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 FSTL4Q6MZW2 842 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 TMC2Q8TDI7 906 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 OSCP1Q8WVF1 389 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa24.17■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 K7ESF4 209 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF202O95125 648 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 HOXC13P31276 330 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 IFNAR2P48551 515 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 FNTBP49356 437 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 PKN3Q6P5Z2 889 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 FAM35AQ86V20 835 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 SYNPOQ8N3V7 929 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 CPA6Q8N4T0 437 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 ECT2Q9H8V3 914 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 EHD2Q9NZN4 543 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa24.16■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 DNAH14Q0VDD8 3507 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 KIF20AO95235 890 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 ABL1P00519 1130 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 NR2F2P24468 414 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 GJA4P35212 333 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 PIK3CAP42336 1068 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 ID4P47928 161 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 ZXDBP98169 803 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 TAF10Q12962 218 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 ORC1Q13415 861 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 EML3Q32P44 896 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 SPOPLQ6IQ16 392 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 SV2AQ7L0J3 742 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 ATP2A3Q93084 1043 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 MED10Q9BTT4 135 aa24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.464e-7■■■■■ 108.1
PPP4C-212ENST00000567828 ATP8B3O60423 1300 aa24.14■■□□□ 1.46
PPP4C-212ENST00000567828 CACNA1AO00555 2505 aa24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms