RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	NUP93	Q8N1F7	819 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TTC16	Q8NEE8	873 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC22A12	Q96S37	553 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	MED10	Q9BTT4	135 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SDCBP2	Q9H190	292 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	EBF3	Q9H4W6	596 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	RMND1	Q9NWS8	449 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	GCNT4	Q9P109	453 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TSC2	P49815	1807 aa		10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SMC2	O95347	1197 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	HLA-DRA	P01903	254 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	PIK3CA	P42336	1068 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	GCLM	P48507	274 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CACNA2D1	P54289	1103 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ENPEP	Q07075	957 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TAF10	Q12962	218 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	PNOC	Q13519	176 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	MTF1	Q14872	753 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ACOT1	Q86TX2	421 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	UNC93A	Q86WB7	457 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	NELL1	Q92832	810 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	EXOC4	Q96A65	974 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	GSDMA	Q96QA5	445 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNK16	Q96T55	309 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	HPS4	Q9NQG7	708 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP8B3	O60423	1300 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TCHH	Q07283	1943 aa		9.99	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CETN3	O15182	167 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	LILRB5	O75023	590 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM49	P0CI25	452 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM49C	P0CI26	452 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ARSA	P15289	507 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TCF3	P15923	654 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	YWHAQ	P27348	245 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	PRCP	P42785	496 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	IFNAR2	P48551	515 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	GALK1	P51570	392 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	NDST1	P52848	882 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SATB1	Q01826	763 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	PPP3CA	Q08209	521 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	NR1H3	Q13133	447 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	GAS6	Q14393	721 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF77	Q15935	545 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM35A	Q86V20	835 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CPA6	Q8N4T0	437 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	RIN3	Q8TB24	985 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	RUBCN	Q92622	972 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TIGD1	Q96MW7	591 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	HINFP	Q9BQA5	517 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF38	Q9H0F5	515 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	ECT2	Q9H8V3	914 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	COMMD8	Q9NX08	183 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		9.98	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	LEFTY2	O00292	366 aa		9.97	□□□□□ -0.81
KIFC3-231	ENST00000567479	STX10	O60499	249 aa		9.97	□□□□□ -0.81

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