RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546935.5

CSRNP2-202, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene CSRNP2, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2-202ENST00000546935 PLVAPQ9BX97 442 aa23.08■■□□□ 1.29
CSRNP2-202ENST00000546935 DUSP16Q9BY84 665 aa23.08■■□□□ 1.29
CSRNP2-202ENST00000546935 UVRAGQ9P2Y5 699 aa23.08■■□□□ 1.29
CSRNP2-202ENST00000546935 STK39Q9UEW8 545 aa23.08■■□□□ 1.29
CSRNP2-202ENST00000546935 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CSRNP2-202ENST00000546935 STRIP2Q9ULQ0 834 aa23.08■■□□□ 1.29
CSRNP2-202ENST00000546935 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.08■■□□□ 1.29
CSRNP2-202ENST00000546935 MACROD2A1Z1Q3 448 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 RRM1P23921 792 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 ADORA2BP29275 332 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 PLA2G4AP47712 749 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 PDE4CQ08493 712 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 USP41Q3LFD5 358 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 LIN9Q5TKA1 542 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 ANKS3Q6ZW76 656 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 GPR65Q8IYL9 337 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 SLC35G2Q8TBE7 412 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 PIK3R5Q8WYR1 880 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 MYLPFQ96A32 169 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 TMEM169Q96HH4 297 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 CPXM1Q96SM3 734 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 LMAN2LQ9H0V9 348 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 TMLHEQ9NVH6 421 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 PATJQ8NI35 1801 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.07■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 MOCS3O95396 460 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 TNNT1P13805 278 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 NPR3P17342 541 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 BMPR1AP36894 532 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 CTXN3Q4LDR2 81 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 PMF1Q6P1K2 205 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 CLEC20AQ6ZU45 233 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 TMEM110Q86TL2 294 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 TRIM58Q8NG06 486 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 C18orf8Q96DM3 657 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 HSFY1Q96LI6 401 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 ASB2Q96Q27 587 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 UBXN6Q9BZV1 441 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 MIS12Q9H081 205 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 WDR35Q9P2L0 1181 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 MTRRQ9UBK8 725 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 BACE2Q9Y5Z0 518 aa23.06■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 CLDN5O00501 218 aa23.05■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 FAM200BP0CF97 657 aa23.05■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 GNG11P61952 73 aa23.05■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.05■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 CEP57Q86XR8 500 aa23.05■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 TPCN2Q8NHX9 752 aa23.05■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 KCTD13Q8WZ19 329 aa23.05■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 SMARCD1Q96GM5 515 aa23.05■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 B3GALT6Q96L58 329 aa23.05■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 MED10Q9BTT4 135 aa23.05■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 OSGEPQ9NPF4 335 aa23.05■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 SCINQ9Y6U3 715 aa23.05■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 FAM170AA1A519 330 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 TULP2O00295 520 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 FANCGO15287 622 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 BUB1O43683 1085 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 ERBB2P04626 1255 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 CTNNB1P35222 781 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 SLC8A3P57103 927 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 SNX16P57768 344 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 DSG1Q02413 1049 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 SMARCB1Q12824 385 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 GPM6BQ13491 265 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 MAMLD1Q13495 774 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 CFAP221Q4G0U5 840 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 C2CD6Q53TS8 623 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 ZNF569Q5MCW4 686 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 SLFN11Q7Z7L1 901 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 XYLT1Q86Y38 959 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 SLC35F6Q8N357 371 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 C3orf20Q8ND61 904 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 MCRS1Q96EZ8 462 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 WDR24Q96S15 920 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 NUP85Q9BW27 656 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 PRDM6Q9NQX0 595 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 KRT82Q9NSB4 513 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 TJP2Q9UDY2 1190 aa23.04■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 GRID2IPA4D2P6 1211 aa23.03■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 GABBR2O75899 941 aa23.03■■□□□ 1.28
CSRNP2-202ENST00000546935 ACADSBP45954 432 aa23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms