RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TEX33O43247 280 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MAN1A2O60476 641 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RHOBTB1O94844 696 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINB8P50452 374 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PRKAA2P54646 552 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MRIQ9BWK5 157 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 NLNQ9BYT8 704 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 EPN3Q9H201 632 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DDIT4Q9NX09 232 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 POLLQ9UGP5 575 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RNF112Q9ULX5 631 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DTNAQ9Y4J8 743 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 C2CD2LO14523 706 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PJA2O43164 708 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RANBP1P43487 201 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PTPN21Q16825 1174 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FBXL16Q8N461 479 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA17Q96L03 361 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FAM50BQ9Y247 325 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RAD54BQ9Y620 910 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MYH7BA7E2Y1 1941 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MEGF6O75095 1541 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SNTNA6NMZ2 147 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 F5H423 210 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 UBXN8O00124 270 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 AKR1A1P14550 325 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DSG3P32926 999 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SKOR1P84550 965 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DMTNQ08495 405 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PEX6Q13608 980 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 C16orf87Q6PH81 154 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SLC22A9Q8IVM8 553 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MAGEC3Q8TD91 643 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FAM161BQ96MY7 647 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CAMKK2Q96RR4 588 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 USP18Q9UMW8 372 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PYGMP11217 842 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RAG1P15918 1043 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 EPHB2P29323 1055 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ERAP2Q6P179 960 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 NLRP14Q86W24 1093 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM69Q86WT6 500 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 UROC1Q96N76 676 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RMND5AQ9H871 391 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 TMCO1Q9UM00 188 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 MST1RQ04912 1400 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RAP1GDS1P52306 607 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 KCNK10P57789 538 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 UBA3Q8TBC4 463 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ERP44Q9BS26 406 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DCLK3Q9C098 648 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 APOA1P02647 267 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-226ENST00000546160 ERVK-10P10266 1014 aa6.63□□□□□ -1.35
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