RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 E9PAM4 449 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEXIO95424 95 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSH1P0DML2 217 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSH2P0DML3 217 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRPAP1P30533 357 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRIA2P42262 883 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PEX3P56589 373 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LILRA4P59901 499 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZXDBP98169 803 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BNC1Q01954 994 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPZL3Q6UWV2 235 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMPRSS12Q86WS5 348 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPPL2BQ8TCT7 592 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FGF11Q92914 225 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXJ1Q92949 421 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM206Q9H813 350 aa11□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOTCH2Q04721 2471 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KNTC1P50748 2209 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GVT2 93 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LEFTY2O00292 366 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPLX1O14810 134 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF883P0CG24 379 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADSSP30520 456 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HNF1BP35680 557 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFRSF4P43489 277 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL9RQ01113 521 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTPRNQ16849 979 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL27RAQ6UWB1 636 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DBX2Q6ZNG2 339 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP49Q70CQ1 688 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAS1R3Q7RTX0 852 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 METTL23Q86XA0 190 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MIB1Q86YT6 1006 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THEM5Q8N1Q8 247 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM212AQ96EL1 285 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM176AQ96HP8 235 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACOX2Q99424 681 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LGMNQ99538 433 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR174Q9BXC1 333 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMLHEQ9NVH6 421 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMPD4Q9NXE4 827 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAD54BQ9Y620 910 aa10.99□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PQF6 199 aa10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABLIM1O14639 778 aa10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BRINP1O60477 761 aa10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NCAM1P13591 858 aa10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PROZP22891 400 aa10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPTX2P47972 431 aa10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RHDQ02161 417 aa10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT32Q14532 448 aa10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C10orf76Q5T2E6 689 aa10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RHBDF2Q6PJF5 856 aa10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIFAP3Q92845 792 aa10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GCNT4Q9P109 453 aa10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RELNP78509 3460 aa10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CITO14578 2027 aa10.97□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LACTBL1A8MY62 500 aa10.97□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CBX4O00257 560 aa10.97□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYB561D2O14569 222 aa10.97□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM66O15016 1216 aa10.97□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM24O15164 1050 aa10.97□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADH5P11766 374 aa10.97□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYP2F1P24903 491 aa10.97□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD6P30203 668 aa10.97□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NTSR1P30989 418 aa10.97□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRK6P43250 576 aa10.97□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP2R3AQ06190 1150 aa10.97□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STK3Q13188 491 aa10.97□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.97□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBTB6Q15916 424 aa10.97□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF19Q2TAC6 998 aa10.97□□□□□ -0.65
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSGA10IPQ3SY00 556 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms