RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 AVPR1BP47901 424 aa4.73□□□□□ -1.65
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CLVS1-209ENST00000522928 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
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CLVS1-209ENST00000522928 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 MICU3Q86XE3 530 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF280BQ86YH2 543 aa4.73□□□□□ -1.65
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CLVS1-209ENST00000522928 RAD54BQ9Y620 910 aa4.73□□□□□ -1.65
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CLVS1-209ENST00000522928 FAM227AF5H4B4 570 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 BTN3A1O00481 513 aa4.72□□□□□ -1.65
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CLVS1-209ENST00000522928 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
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CLVS1-209ENST00000522928 CPNE7Q9UBL6 633 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 KIF15Q9NS87 1388 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 NWD1Q149M9 1564 aa4.72□□□□□ -1.65
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CLVS1-209ENST00000522928 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 ADGRB3O60242 1522 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa4.72□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 RIMS2Q9UQ26 1411 aa4.72□□□□□ -1.65
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CLVS1-209ENST00000522928 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
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CLVS1-209ENST00000522928 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
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CLVS1-209ENST00000522928 hCG_1984214I3L0E3 225 aa4.7□□□□□ -1.66
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CLVS1-209ENST00000522928 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-209ENST00000522928 SLC15A4Q8N697 577 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-209ENST00000522928 PGBD1Q96JS3 809 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-209ENST00000522928 ACTRT3Q9BYD9 372 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-209ENST00000522928 SLC52A1Q9NWF4 448 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-209ENST00000522928 COL20A1Q9P218 1284 aa4.7□□□□□ -1.66
CLVS1-209ENST00000522928 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.7□□□□□ -1.66
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